RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
UBE2Q1-201ENST00000292211 FOXD1Q16676 465 aa29.79■■■□□ 2.36
UBE2Q1-201ENST00000292211 DAPK1P53355 1430 aa29.77■■■□□ 2.36
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTPRGP23470 1445 aa29.77■■■□□ 2.36
UBE2Q1-201ENST00000292211 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.75■■■□□ 2.35
UBE2Q1-201ENST00000292211 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABCC5O15440 1437 aa29.73■■■□□ 2.35
UBE2Q1-201ENST00000292211 CHD1O14646 1710 aa29.71■■■□□ 2.35
UBE2Q1-201ENST00000292211 KDM6BO15054 1643 aa29.7■■■□□ 2.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF14Q15058 1648 aa29.69■■■□□ 2.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATP10BO94823 1461 aa29.67■■■□□ 2.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 AKNAQ7Z591 1439 aa29.65■■■□□ 2.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.65■■■□□ 2.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.64■■■□□ 2.34
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABCA8O94911 1581 aa29.6■■■□□ 2.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 ROCK1Q13464 1354 aa29.6■■■□□ 2.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
UBE2Q1-201ENST00000292211 TSPY4P0CV99 314 aa29.55■■■□□ 2.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 TSPY10P0CW01 314 aa29.55■■■□□ 2.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.55■■■□□ 2.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNH8Q96L42 1107 aa29.54■■■□□ 2.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.53■■■□□ 2.32
UBE2Q1-201ENST00000292211 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
UBE2Q1-201ENST00000292211 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.5■■■□□ 2.31
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.5■■■□□ 2.31
UBE2Q1-201ENST00000292211 NCOA1Q15788 1441 aa29.49■■■□□ 2.31
UBE2Q1-201ENST00000292211 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.47■■■□□ 2.31
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.46■■■□□ 2.31
UBE2Q1-201ENST00000292211 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.42■■■□□ 2.3
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.41■■■□□ 2.3
UBE2Q1-201ENST00000292211 PKD2Q13563 968 aa29.39■■■□□ 2.3
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.39■■■□□ 2.3
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.38■■■□□ 2.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.38■■■□□ 2.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.37■■■□□ 2.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANP32CO43423 234 aa29.36■■■□□ 2.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 BCANQ96GW7 911 aa29.34■■■□□ 2.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 NUP155O75694 1391 aa29.34■■■□□ 2.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.29■■■□□ 2.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.29■■■□□ 2.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 OSCARQ8IYS5 282 aa29.29■■■□□ 2.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF15Q9NS87 1388 aa29.29■■■□□ 2.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADGRL2O95490 1459 aa29.28■■■□□ 2.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 PZPP20742 1482 aa29.27■■■□□ 2.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 SHROOM2Q13796 1616 aa29.26■■■□□ 2.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.26■■■□□ 2.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.26■■■□□ 2.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.273e-7■■■□□ 14.6
UBE2Q1-201ENST00000292211 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.24■■■□□ 2.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABCC2Q92887 1545 aa29.23■■■□□ 2.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.22■■■□□ 2.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.21■■■□□ 2.27
UBE2Q1-201ENST00000292211 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.19■■■□□ 2.26
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.18■■■□□ 2.26
UBE2Q1-201ENST00000292211 MBD5Q9P267 1494 aa29.17■■■□□ 2.26
UBE2Q1-201ENST00000292211 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.17■■■□□ 2.26
UBE2Q1-201ENST00000292211 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.16■■■□□ 2.26
UBE2Q1-201ENST00000292211 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.15■■■□□ 2.26
UBE2Q1-201ENST00000292211 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.15■■■□□ 2.26
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.15■■■□□ 2.26
UBE2Q1-201ENST00000292211 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.15■■■□□ 2.26
UBE2Q1-201ENST00000292211 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.14■■■□□ 2.26
UBE2Q1-201ENST00000292211 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.261e-7■■■■□ 19.9
UBE2Q1-201ENST00000292211 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.14■■■□□ 2.25
UBE2Q1-201ENST00000292211 PREX2Q70Z35 1606 aa29.12■■■□□ 2.25
UBE2Q1-201ENST00000292211 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.11■■■□□ 2.25
UBE2Q1-201ENST00000292211 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.11■■■□□ 2.25
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.09■■■□□ 2.25
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.07■■■□□ 2.24
UBE2Q1-201ENST00000292211 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
UBE2Q1-201ENST00000292211 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCER2I3L3R5 266 aa29.04■■■□□ 2.24
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
UBE2Q1-201ENST00000292211 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.02■■■□□ 2.24
UBE2Q1-201ENST00000292211 RGL3Q3MIN7 710 aa29.01■■■□□ 2.23
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29■■■□□ 2.23
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.98■■■□□ 2.23
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLCH2O75038 1416 aa28.97■■■□□ 2.23
UBE2Q1-201ENST00000292211 AFAP1Q8N556 730 aa28.96■■■□□ 2.23
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.96■■■□□ 2.23
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC7Q96M83 1385 aa28.95■■■□□ 2.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.94■■■□□ 2.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.93■■■□□ 2.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.92■■■□□ 2.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.9■■■□□ 2.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.9■■■□□ 2.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP47Q96K76 1375 aa28.9■■■□□ 2.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.88■■■□□ 2.21
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