RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287507.7

BCKDK-202, Transcript of branched chain ketoacid dehydrogenase kinase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDK, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDK-202ENST00000287507 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
BCKDK-202ENST00000287507 DAPK1P53355 1430 aa29.28■■■□□ 2.28
BCKDK-202ENST00000287507 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.28■■■□□ 2.28
BCKDK-202ENST00000287507 ABCC5O15440 1437 aa29.27■■■□□ 2.28
BCKDK-202ENST00000287507 AKNAQ7Z591 1439 aa29.26■■■□□ 2.28
BCKDK-202ENST00000287507 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
BCKDK-202ENST00000287507 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.24■■■□□ 2.27
BCKDK-202ENST00000287507 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.24■■■□□ 2.27
BCKDK-202ENST00000287507 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.24■■■□□ 2.27
BCKDK-202ENST00000287507 ROCK1Q13464 1354 aa29.22■■■□□ 2.27
BCKDK-202ENST00000287507 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.2■■■□□ 2.26
BCKDK-202ENST00000287507 PREX2Q70Z35 1606 aa29.18■■■□□ 2.26
BCKDK-202ENST00000287507 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.15■■■□□ 2.26
BCKDK-202ENST00000287507 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.14■■■□□ 2.26
BCKDK-202ENST00000287507 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.14■■■□□ 2.26
BCKDK-202ENST00000287507 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.14■■■□□ 2.26
BCKDK-202ENST00000287507 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.25
BCKDK-202ENST00000287507 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.13■■■□□ 2.25
BCKDK-202ENST00000287507 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.12■■■□□ 2.25
BCKDK-202ENST00000287507 ASXL2Q76L83 1435 aa29.12■■■□□ 2.25
BCKDK-202ENST00000287507 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
BCKDK-202ENST00000287507 MAPKBP1O60336 1514 aa29.11■■■□□ 2.25
BCKDK-202ENST00000287507 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.1■■■□□ 2.25
BCKDK-202ENST00000287507 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.09■■■□□ 2.25
BCKDK-202ENST00000287507 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.08■■■□□ 2.25
BCKDK-202ENST00000287507 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.08■■■□□ 2.25
BCKDK-202ENST00000287507 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
BCKDK-202ENST00000287507 TSPY4P0CV99 314 aa29.06■■■□□ 2.24
BCKDK-202ENST00000287507 TSPY10P0CW01 314 aa29.06■■■□□ 2.24
BCKDK-202ENST00000287507 PLCH2O75038 1416 aa29.06■■■□□ 2.24
BCKDK-202ENST00000287507 NCOA1Q15788 1441 aa29.06■■■□□ 2.24
BCKDK-202ENST00000287507 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.05■■■□□ 2.24
BCKDK-202ENST00000287507 ADGRL2O95490 1459 aa29.04■■■□□ 2.24
BCKDK-202ENST00000287507 MBD5Q9P267 1494 aa29.03■■■□□ 2.24
BCKDK-202ENST00000287507 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.03■■■□□ 2.24
BCKDK-202ENST00000287507 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.02■■■□□ 2.24
BCKDK-202ENST00000287507 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.02■■■□□ 2.24
BCKDK-202ENST00000287507 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.01■■■□□ 2.23
BCKDK-202ENST00000287507 TRIM52Q96A61 297 aa29■■■□□ 2.23
BCKDK-202ENST00000287507 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.99■■■□□ 2.23
BCKDK-202ENST00000287507 KDM6BO15054 1643 aa28.99■■■□□ 2.23
BCKDK-202ENST00000287507 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.98■■■□□ 2.23
BCKDK-202ENST00000287507 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.98■■■□□ 2.23
BCKDK-202ENST00000287507 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.98■■■□□ 2.23
BCKDK-202ENST00000287507 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.97■■■□□ 2.23
BCKDK-202ENST00000287507 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.96■■■□□ 2.23
BCKDK-202ENST00000287507 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.96■■■□□ 2.23
BCKDK-202ENST00000287507 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.92■■■□□ 2.22
BCKDK-202ENST00000287507 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.92■■■□□ 2.22
BCKDK-202ENST00000287507 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.9■■■□□ 2.22
BCKDK-202ENST00000287507 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.89■■■□□ 2.22
BCKDK-202ENST00000287507 NEUROD1Q13562 356 aa28.88■■■□□ 2.21
BCKDK-202ENST00000287507 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.88■■■□□ 2.21
BCKDK-202ENST00000287507 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.86■■■□□ 2.21
BCKDK-202ENST00000287507 ABCC1P33527 1531 aa28.85■■■□□ 2.21
BCKDK-202ENST00000287507 FANCAO15360 1455 aa28.83■■■□□ 2.21
BCKDK-202ENST00000287507 KIF15Q9NS87 1388 aa28.83■■■□□ 2.21
BCKDK-202ENST00000287507 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.81■■■□□ 2.2
BCKDK-202ENST00000287507 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
BCKDK-202ENST00000287507 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
BCKDK-202ENST00000287507 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.78■■■□□ 2.2
BCKDK-202ENST00000287507 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
BCKDK-202ENST00000287507 CD109Q6YHK3 1445 aa28.77■■■□□ 2.2
BCKDK-202ENST00000287507 AFAP1Q8N556 730 aa28.71■■■□□ 2.19
BCKDK-202ENST00000287507 ADGRL1O94910 1474 aa28.71■■■□□ 2.19
BCKDK-202ENST00000287507 PZPP20742 1482 aa28.7■■■□□ 2.19
BCKDK-202ENST00000287507 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.68■■■□□ 2.18
BCKDK-202ENST00000287507 TONSLQ96HA7 1378 aa28.68■■■□□ 2.18
BCKDK-202ENST00000287507 PLXNC1O60486 1568 aa28.67■■■□□ 2.18
BCKDK-202ENST00000287507 FOXD1Q16676 465 aa28.67■■■□□ 2.18
BCKDK-202ENST00000287507 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
BCKDK-202ENST00000287507 NUP155O75694 1391 aa28.66■■■□□ 2.18
BCKDK-202ENST00000287507 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.66■■■□□ 2.18
BCKDK-202ENST00000287507 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
BCKDK-202ENST00000287507 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.65■■■□□ 2.18
BCKDK-202ENST00000287507 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.62■■■□□ 2.17
BCKDK-202ENST00000287507 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.62■■■□□ 2.17
BCKDK-202ENST00000287507 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.61■■■□□ 2.17
BCKDK-202ENST00000287507 GLI2P10070 1586 aa28.61■■■□□ 2.17
BCKDK-202ENST00000287507 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.6■■■□□ 2.17
BCKDK-202ENST00000287507 PKD2Q13563 968 aa28.59■■■□□ 2.17
BCKDK-202ENST00000287507 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.59■■■□□ 2.17
BCKDK-202ENST00000287507 DIP2BQ9P265 1576 aa28.58■■■□□ 2.17
BCKDK-202ENST00000287507 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.58■■■□□ 2.17
BCKDK-202ENST00000287507 ERBINQ96RT1 1412 aa28.57■■■□□ 2.16
BCKDK-202ENST00000287507 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
BCKDK-202ENST00000287507 ATP7AQ04656 1500 aa28.54■■■□□ 2.16
BCKDK-202ENST00000287507 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.53■■■□□ 2.16
BCKDK-202ENST00000287507 NEO1Q92859 1461 aa28.53■■■□□ 2.16
BCKDK-202ENST00000287507 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
BCKDK-202ENST00000287507 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.51■■■□□ 2.15
BCKDK-202ENST00000287507 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
BCKDK-202ENST00000287507 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.49■■■□□ 2.15
BCKDK-202ENST00000287507 UNC13BO14795 1591 aa28.48■■■□□ 2.15
BCKDK-202ENST00000287507 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.47■■■□□ 2.15
BCKDK-202ENST00000287507 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.151e-8■■■□□ 16.7
BCKDK-202ENST00000287507 TSPOAP1O95153 1857 aa28.46■■■□□ 2.15
BCKDK-202ENST00000287507 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.46■■■□□ 2.15
BCKDK-202ENST00000287507 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.44■■■□□ 2.14
BCKDK-202ENST00000287507 KDM5CP41229 1560 aa28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms