RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285896.10

CNOT8-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT8, Length 2,528 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-201ENST00000285896 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.64■■□□□ 1.21
CNOT8-201ENST00000285896 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.63■■□□□ 1.21
CNOT8-201ENST00000285896 DAPK1P53355 1430 aa22.62■■□□□ 1.21
CNOT8-201ENST00000285896 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.61■■□□□ 1.21
CNOT8-201ENST00000285896 AKNAQ7Z591 1439 aa22.61■■□□□ 1.21
CNOT8-201ENST00000285896 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CNOT8-201ENST00000285896 ABCC5O15440 1437 aa22.59■■□□□ 1.21
CNOT8-201ENST00000285896 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.59■■□□□ 1.21
CNOT8-201ENST00000285896 MAPKBP1O60336 1514 aa22.58■■□□□ 1.21
CNOT8-201ENST00000285896 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
CNOT8-201ENST00000285896 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.57■■□□□ 1.2
CNOT8-201ENST00000285896 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.57■■□□□ 1.2
CNOT8-201ENST00000285896 ROCK1Q13464 1354 aa22.55■■□□□ 1.2
CNOT8-201ENST00000285896 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CNOT8-201ENST00000285896 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.53■■□□□ 1.2
CNOT8-201ENST00000285896 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
CNOT8-201ENST00000285896 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.47■■□□□ 1.19
CNOT8-201ENST00000285896 PREX2Q70Z35 1606 aa22.47■■□□□ 1.19
CNOT8-201ENST00000285896 KCNH8Q96L42 1107 aa22.47■■□□□ 1.19
CNOT8-201ENST00000285896 KDM6BO15054 1643 aa22.43■■□□□ 1.18
CNOT8-201ENST00000285896 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.43■■□□□ 1.18
CNOT8-201ENST00000285896 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.43■■□□□ 1.18
CNOT8-201ENST00000285896 NCOA1Q15788 1441 aa22.42■■□□□ 1.18
CNOT8-201ENST00000285896 ADGRL2O95490 1459 aa22.42■■□□□ 1.18
CNOT8-201ENST00000285896 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.4■■□□□ 1.18
CNOT8-201ENST00000285896 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.4■■□□□ 1.18
CNOT8-201ENST00000285896 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.4■■□□□ 1.18
CNOT8-201ENST00000285896 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.39■■□□□ 1.18
CNOT8-201ENST00000285896 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.173e-7■■■■□ 21.6
CNOT8-201ENST00000285896 TRIM52Q96A61 297 aa22.39■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.39■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.38■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 MBD5Q9P267 1494 aa22.38■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.38■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.37■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.37■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.37■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 TSPY4P0CV99 314 aa22.36■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 TSPY10P0CW01 314 aa22.36■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 PLCH2O75038 1416 aa22.35■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.34■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.34■■□□□ 1.17
CNOT8-201ENST00000285896 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.32■■□□□ 1.16
CNOT8-201ENST00000285896 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.32■■□□□ 1.16
CNOT8-201ENST00000285896 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.31■■□□□ 1.16
CNOT8-201ENST00000285896 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CNOT8-201ENST00000285896 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.31■■□□□ 1.16
CNOT8-201ENST00000285896 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.3■■□□□ 1.16
CNOT8-201ENST00000285896 ASXL2Q76L83 1435 aa22.3■■□□□ 1.16
CNOT8-201ENST00000285896 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
CNOT8-201ENST00000285896 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.29■■□□□ 1.16
CNOT8-201ENST00000285896 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CNOT8-201ENST00000285896 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.28■■□□□ 1.16
CNOT8-201ENST00000285896 KIF15Q9NS87 1388 aa22.25■■□□□ 1.15
CNOT8-201ENST00000285896 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.25■■□□□ 1.15
CNOT8-201ENST00000285896 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.22■■□□□ 1.15
CNOT8-201ENST00000285896 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.22■■□□□ 1.15
CNOT8-201ENST00000285896 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CNOT8-201ENST00000285896 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.21■■□□□ 1.15
CNOT8-201ENST00000285896 ABCC1P33527 1531 aa22.21■■□□□ 1.15
CNOT8-201ENST00000285896 TONSLQ96HA7 1378 aa22.2■■□□□ 1.14
CNOT8-201ENST00000285896 MIER1Q8N108 512 aa22.19■■□□□ 1.14
CNOT8-201ENST00000285896 PZPP20742 1482 aa22.19■■□□□ 1.14
CNOT8-201ENST00000285896 FOXD1Q16676 465 aa22.17■■□□□ 1.14
CNOT8-201ENST00000285896 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CNOT8-201ENST00000285896 FANCAO15360 1455 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT8-201ENST00000285896 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.15■■□□□ 1.14
CNOT8-201ENST00000285896 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.14■■□□□ 1.14
CNOT8-201ENST00000285896 PLXNC1O60486 1568 aa22.13■■□□□ 1.13
CNOT8-201ENST00000285896 NUP155O75694 1391 aa22.12■■□□□ 1.13
CNOT8-201ENST00000285896 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.11■■□□□ 1.13
CNOT8-201ENST00000285896 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.1■■□□□ 1.13
CNOT8-201ENST00000285896 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.09■■□□□ 1.13
CNOT8-201ENST00000285896 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.09■■□□□ 1.13
CNOT8-201ENST00000285896 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.09■■□□□ 1.13
CNOT8-201ENST00000285896 PKD2Q13563 968 aa22.08■■□□□ 1.12
CNOT8-201ENST00000285896 AFAP1Q8N556 730 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT8-201ENST00000285896 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CNOT8-201ENST00000285896 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT8-201ENST00000285896 ADGRL1O94910 1474 aa22.06■■□□□ 1.12
CNOT8-201ENST00000285896 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT8-201ENST00000285896 CD109Q6YHK3 1445 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT8-201ENST00000285896 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CNOT8-201ENST00000285896 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.04■■□□□ 1.12
CNOT8-201ENST00000285896 ERBINQ96RT1 1412 aa22.03■■□□□ 1.12
CNOT8-201ENST00000285896 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.02■■□□□ 1.11
CNOT8-201ENST00000285896 UNC13BO14795 1591 aa21.99■■□□□ 1.11
CNOT8-201ENST00000285896 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.99■■□□□ 1.11
CNOT8-201ENST00000285896 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.98■■□□□ 1.11
CNOT8-201ENST00000285896 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.97■■□□□ 1.11
CNOT8-201ENST00000285896 ATP7AQ04656 1500 aa21.96■■□□□ 1.11
CNOT8-201ENST00000285896 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CNOT8-201ENST00000285896 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.11e-8■□□□□ 11.1
CNOT8-201ENST00000285896 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.95■■□□□ 1.1
CNOT8-201ENST00000285896 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.93■■□□□ 1.1
CNOT8-201ENST00000285896 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.93■■□□□ 1.1
CNOT8-201ENST00000285896 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.92■■□□□ 1.1
CNOT8-201ENST00000285896 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.91■■□□□ 1.1
CNOT8-201ENST00000285896 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.7 ms