RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 ROCK1Q13464 1354 aa27.51■■□□□ 1.99
GDPD1-201ENST00000284116 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.5■■□□□ 1.99
GDPD1-201ENST00000284116 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.5■■□□□ 1.99
GDPD1-201ENST00000284116 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.49■■□□□ 1.99
GDPD1-201ENST00000284116 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.48■■□□□ 1.99
GDPD1-201ENST00000284116 KDM6BO15054 1643 aa27.45■■□□□ 1.98
GDPD1-201ENST00000284116 NEUROD1Q13562 356 aa27.44■■□□□ 1.98
GDPD1-201ENST00000284116 ABCC2Q92887 1545 aa27.44■■□□□ 1.98
GDPD1-201ENST00000284116 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
GDPD1-201ENST00000284116 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
GDPD1-201ENST00000284116 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.38■■□□□ 1.97
GDPD1-201ENST00000284116 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.37■■□□□ 1.97
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM52Q96A61 297 aa27.34■■□□□ 1.97
GDPD1-201ENST00000284116 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.34■■□□□ 1.97
GDPD1-201ENST00000284116 ADGRL2O95490 1459 aa27.33■■□□□ 1.97
GDPD1-201ENST00000284116 NCOA1Q15788 1441 aa27.32■■□□□ 1.96
GDPD1-201ENST00000284116 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
GDPD1-201ENST00000284116 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.3■■□□□ 1.96
GDPD1-201ENST00000284116 PREX2Q70Z35 1606 aa27.29■■□□□ 1.96
GDPD1-201ENST00000284116 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.28■■□□□ 1.96
GDPD1-201ENST00000284116 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
GDPD1-201ENST00000284116 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
GDPD1-201ENST00000284116 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.25■■□□□ 1.95
GDPD1-201ENST00000284116 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.25■■□□□ 1.95
GDPD1-201ENST00000284116 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.25■■□□□ 1.95
GDPD1-201ENST00000284116 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.24■■□□□ 1.95
GDPD1-201ENST00000284116 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
GDPD1-201ENST00000284116 TONSLQ96HA7 1378 aa27.23■■□□□ 1.95
GDPD1-201ENST00000284116 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.22■■□□□ 1.95
GDPD1-201ENST00000284116 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.21■■□□□ 1.95
GDPD1-201ENST00000284116 MBD5Q9P267 1494 aa27.2■■□□□ 1.94
GDPD1-201ENST00000284116 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.19■■□□□ 1.94
GDPD1-201ENST00000284116 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
GDPD1-201ENST00000284116 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.17■■□□□ 1.94
GDPD1-201ENST00000284116 TSPY4P0CV99 314 aa27.17■■□□□ 1.94
GDPD1-201ENST00000284116 TSPY10P0CW01 314 aa27.17■■□□□ 1.94
GDPD1-201ENST00000284116 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.16■■□□□ 1.94
GDPD1-201ENST00000284116 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.14■■□□□ 1.93
GDPD1-201ENST00000284116 KCNH8Q96L42 1107 aa27.13■■□□□ 1.93
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.12■■□□□ 1.93
GDPD1-201ENST00000284116 OSCARQ8IYS5 282 aa27.12■■□□□ 1.93
GDPD1-201ENST00000284116 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.12■■□□□ 1.93
GDPD1-201ENST00000284116 MIER1Q8N108 512 aa27.11■■□□□ 1.93
GDPD1-201ENST00000284116 PZPP20742 1482 aa27.1■■□□□ 1.93
GDPD1-201ENST00000284116 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
GDPD1-201ENST00000284116 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.1■■□□□ 1.93
GDPD1-201ENST00000284116 FOXD1Q16676 465 aa27.07■■□□□ 1.92
GDPD1-201ENST00000284116 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.07■■□□□ 1.92
GDPD1-201ENST00000284116 PLCH2O75038 1416 aa27.07■■□□□ 1.92
GDPD1-201ENST00000284116 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.06■■□□□ 1.92
GDPD1-201ENST00000284116 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.06■■□□□ 1.92
GDPD1-201ENST00000284116 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.04■■□□□ 1.92
GDPD1-201ENST00000284116 KIF15Q9NS87 1388 aa27.03■■□□□ 1.92
GDPD1-201ENST00000284116 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
GDPD1-201ENST00000284116 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27■■□□□ 1.91
GDPD1-201ENST00000284116 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.97■■□□□ 1.91
GDPD1-201ENST00000284116 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.97■■□□□ 1.91
GDPD1-201ENST00000284116 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.96■■□□□ 1.91
GDPD1-201ENST00000284116 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.95■■□□□ 1.9
GDPD1-201ENST00000284116 NUP155O75694 1391 aa26.94■■□□□ 1.9
GDPD1-201ENST00000284116 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.93■■□□□ 1.9
GDPD1-201ENST00000284116 PKD2Q13563 968 aa26.93■■□□□ 1.9
GDPD1-201ENST00000284116 PLXNC1O60486 1568 aa26.91■■□□□ 1.9
GDPD1-201ENST00000284116 ABCC1P33527 1531 aa26.91■■□□□ 1.9
GDPD1-201ENST00000284116 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.88■■□□□ 1.89
GDPD1-201ENST00000284116 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.87■■□□□ 1.89
GDPD1-201ENST00000284116 ASXL2Q76L83 1435 aa26.85■■□□□ 1.89
GDPD1-201ENST00000284116 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
GDPD1-201ENST00000284116 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.82■■□□□ 1.88
GDPD1-201ENST00000284116 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.82■■□□□ 1.88
GDPD1-201ENST00000284116 UNC13BO14795 1591 aa26.81■■□□□ 1.88
GDPD1-201ENST00000284116 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
GDPD1-201ENST00000284116 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
GDPD1-201ENST00000284116 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.78■■□□□ 1.88
GDPD1-201ENST00000284116 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
GDPD1-201ENST00000284116 FANCAO15360 1455 aa26.76■■□□□ 1.88
GDPD1-201ENST00000284116 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.75■■□□□ 1.87
GDPD1-201ENST00000284116 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.75■■□□□ 1.87
GDPD1-201ENST00000284116 ERBINQ96RT1 1412 aa26.75■■□□□ 1.87
GDPD1-201ENST00000284116 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
GDPD1-201ENST00000284116 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
GDPD1-201ENST00000284116 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.71■■□□□ 1.87
GDPD1-201ENST00000284116 AFAP1Q8N556 730 aa26.71■■□□□ 1.87
GDPD1-201ENST00000284116 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.87
GDPD1-201ENST00000284116 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.69■■□□□ 1.86
GDPD1-201ENST00000284116 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.68■■□□□ 1.86
GDPD1-201ENST00000284116 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
GDPD1-201ENST00000284116 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
GDPD1-201ENST00000284116 ADGRL1O94910 1474 aa26.66■■□□□ 1.86
GDPD1-201ENST00000284116 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.65■■□□□ 1.86
GDPD1-201ENST00000284116 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
GDPD1-201ENST00000284116 ATP7AQ04656 1500 aa26.61■■□□□ 1.85
GDPD1-201ENST00000284116 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.6■■□□□ 1.85
GDPD1-201ENST00000284116 CD109Q6YHK3 1445 aa26.57■■□□□ 1.84
GDPD1-201ENST00000284116 PLA2R1Q13018 1463 aa26.57■■□□□ 1.84
GDPD1-201ENST00000284116 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.57■■□□□ 1.84
GDPD1-201ENST00000284116 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.56■■□□□ 1.84
GDPD1-201ENST00000284116 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.55■■□□□ 1.84
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.55■■□□□ 1.84
GDPD1-201ENST00000284116 ATP10AO60312 1499 aa26.54■■□□□ 1.84
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