RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 ARID3CA6NKF2 412 aa39.35■■■■□ 3.89
UBP1-201ENST00000283628 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.33■■■■□ 3.89
UBP1-201ENST00000283628 ROCK1Q13464 1354 aa39.29■■■■□ 3.88
UBP1-201ENST00000283628 ABCA8O94911 1581 aa39.27■■■■□ 3.88
UBP1-201ENST00000283628 TRIM52Q96A61 297 aa39.26■■■■□ 3.88
UBP1-201ENST00000283628 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
UBP1-201ENST00000283628 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
UBP1-201ENST00000283628 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.22■■■■□ 3.87
UBP1-201ENST00000283628 DAPK1P53355 1430 aa39.22■■■■□ 3.87
UBP1-201ENST00000283628 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
UBP1-201ENST00000283628 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
UBP1-201ENST00000283628 SHROOM2Q13796 1616 aa39.18■■■■□ 3.86
UBP1-201ENST00000283628 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.15■■■■□ 3.86
UBP1-201ENST00000283628 FKBP8Q14318 412 aa39.15■■■■□ 3.86
UBP1-201ENST00000283628 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa39.15■■■■□ 3.86
UBP1-201ENST00000283628 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
UBP1-201ENST00000283628 ABCC5O15440 1437 aa39.12■■■■□ 3.85
UBP1-201ENST00000283628 NEFLP07196 543 aa39.12■■■■□ 3.85
UBP1-201ENST00000283628 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP39.1■■■■□ 3.85
UBP1-201ENST00000283628 WASHC2AQ641Q2 1341 aa39.08■■■■□ 3.85
UBP1-201ENST00000283628 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.85
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.05■■■■□ 3.84
UBP1-201ENST00000283628 PTPRGP23470 1445 aa39.05■■■■□ 3.84
UBP1-201ENST00000283628 ATP10BO94823 1461 aa39.04■■■■□ 3.84
UBP1-201ENST00000283628 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.02■■■■□ 3.84
UBP1-201ENST00000283628 KIF14Q15058 1648 aa39.02■■■■□ 3.84
UBP1-201ENST00000283628 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.01■■■■□ 3.84
UBP1-201ENST00000283628 CNTLNQ9NXG0 1405 aa38.98■■■■□ 3.83
UBP1-201ENST00000283628 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.98■■■■□ 3.83
UBP1-201ENST00000283628 BCANQ96GW7 911 aa38.96■■■■□ 3.83
UBP1-201ENST00000283628 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.94■■■■□ 3.82
UBP1-201ENST00000283628 NCOA1Q15788 1441 aa38.94■■■■□ 3.82
UBP1-201ENST00000283628 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
UBP1-201ENST00000283628 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.93■■■■□ 3.82
UBP1-201ENST00000283628 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
UBP1-201ENST00000283628 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa38.9■■■■□ 3.82
UBP1-201ENST00000283628 FOXD1Q16676 465 aa38.9■■■■□ 3.82
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHD1A6NEE1 506 aa38.89■■■■□ 3.82
UBP1-201ENST00000283628 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP38.89■■■■□ 3.82
UBP1-201ENST00000283628 CCDC7Q96M83 1385 aa38.86■■■■□ 3.81
UBP1-201ENST00000283628 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.86■■■■□ 3.81
UBP1-201ENST00000283628 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.85■■■■□ 3.81
UBP1-201ENST00000283628 CROCC2H7BZ55 1655 aa38.84■■■■□ 3.81
UBP1-201ENST00000283628 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
UBP1-201ENST00000283628 ADGRL2O95490 1459 aa38.83■■■■□ 3.81
UBP1-201ENST00000283628 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.8
UBP1-201ENST00000283628 PZPP20742 1482 aa38.81■■■■□ 3.8
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP38.81■■■■□ 3.8
UBP1-201ENST00000283628 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.79■■■■□ 3.8
UBP1-201ENST00000283628 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa38.78■■■■□ 3.8
UBP1-201ENST00000283628 NBPF8Q3BBV2 869 aa38.77■■■■□ 3.8
UBP1-201ENST00000283628 ABCC2Q92887 1545 aa38.72■■■■□ 3.79
UBP1-201ENST00000283628 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
UBP1-201ENST00000283628 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
UBP1-201ENST00000283628 MBD5Q9P267 1494 aa38.68■■■■□ 3.78
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.68■■■■□ 3.78
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.65■■■■□ 3.78
UBP1-201ENST00000283628 KIF7Q2M1P5 1343 aa38.61■■■■□ 3.77
UBP1-201ENST00000283628 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.6■■■■□ 3.77
UBP1-201ENST00000283628 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
UBP1-201ENST00000283628 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.57■■■■□ 3.77
UBP1-201ENST00000283628 PREX2Q70Z35 1606 aa38.55■■■■□ 3.76
UBP1-201ENST00000283628 ERICH6BQ5W0A0 696 aa38.54■■■■□ 3.76
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.53■■■■□ 3.76
UBP1-201ENST00000283628 CCDC184Q52MB2 194 aa38.52■■■■□ 3.76
UBP1-201ENST00000283628 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.5■■■■□ 3.75
UBP1-201ENST00000283628 MRS2Q9HD23 443 aa38.49■■■■□ 3.75
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.48■■■■□ 3.75
UBP1-201ENST00000283628 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.46■■■■□ 3.75
UBP1-201ENST00000283628 PKD2Q13563 968 aa38.46■■■■□ 3.75
UBP1-201ENST00000283628 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
UBP1-201ENST00000283628 ZBED9Q6R2W3 1325 aa38.46■■■■□ 3.75
UBP1-201ENST00000283628 TTC37Q6PGP7 1564 aa38.45■■■■□ 3.75
UBP1-201ENST00000283628 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP38.44■■■■□ 3.743e-7■■□□□ 12.7
UBP1-201ENST00000283628 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.44■■■■□ 3.74
UBP1-201ENST00000283628 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.44■■■■□ 3.74
UBP1-201ENST00000283628 KDM5CP41229 1560 aa38.43■■■■□ 3.74
UBP1-201ENST00000283628 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.43■■■■□ 3.74
UBP1-201ENST00000283628 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa38.43■■■■□ 3.74
UBP1-201ENST00000283628 USP47Q96K76 1375 aa38.43■■■■□ 3.74
UBP1-201ENST00000283628 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.41■■■■□ 3.74
UBP1-201ENST00000283628 ANP32EQ9BTT0 268 aa38.4■■■■□ 3.74
UBP1-201ENST00000283628 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.39■■■■□ 3.74
UBP1-201ENST00000283628 FAM9BQ8IZU0 186 aa38.39■■■■□ 3.74
UBP1-201ENST00000283628 RALGAPBQ86X10 1494 aa38.36■■■■□ 3.73
UBP1-201ENST00000283628 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
UBP1-201ENST00000283628 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.34■■■■□ 3.73
UBP1-201ENST00000283628 NUP155O75694 1391 aa38.33■■■■□ 3.73
UBP1-201ENST00000283628 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.31■■■■□ 3.72
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.29■■■■□ 3.72
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.29■■■■□ 3.721e-6■■■■□ 26.3
UBP1-201ENST00000283628 TSPY4P0CV99 314 aa38.28■■■■□ 3.72
UBP1-201ENST00000283628 TSPY10P0CW01 314 aa38.28■■■■□ 3.72
UBP1-201ENST00000283628 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
UBP1-201ENST00000283628 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.71
UBP1-201ENST00000283628 PPP4R2Q9NY27 417 aa38.26■■■■□ 3.71
UBP1-201ENST00000283628 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.25■■■■□ 3.71
UBP1-201ENST00000283628 KIF15Q9NS87 1388 aa38.23■■■■□ 3.71
UBP1-201ENST00000283628 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
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