RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.49
PITX1-201ENST00000265340 UACAQ9BZF9 1416 aa30.62■■■□□ 2.49
PITX1-201ENST00000265340 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.61■■■□□ 2.49
PITX1-201ENST00000265340 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.59■■■□□ 2.49
PITX1-201ENST00000265340 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.53■■■□□ 2.48
PITX1-201ENST00000265340 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.53■■■□□ 2.48
PITX1-201ENST00000265340 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.53■■■□□ 2.48
PITX1-201ENST00000265340 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
PITX1-201ENST00000265340 PTPRKQ15262 1439 aa30.51■■■□□ 2.47
PITX1-201ENST00000265340 ABCC2Q92887 1545 aa30.5■■■□□ 2.47
PITX1-201ENST00000265340 ATP10BO94823 1461 aa30.5■■■□□ 2.47
PITX1-201ENST00000265340 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.5■■■□□ 2.47
PITX1-201ENST00000265340 KCNH8Q96L42 1107 aa30.47■■■□□ 2.47
PITX1-201ENST00000265340 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.45■■■□□ 2.47
PITX1-201ENST00000265340 MAPKBP1O60336 1514 aa30.45■■■□□ 2.46
PITX1-201ENST00000265340 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.44■■■□□ 2.46
PITX1-201ENST00000265340 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
PITX1-201ENST00000265340 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.4■■■□□ 2.46
PITX1-201ENST00000265340 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.35■■■□□ 2.45
PITX1-201ENST00000265340 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
PITX1-201ENST00000265340 IL27Q8NEV9 243 aa30.33■■■□□ 2.45
PITX1-201ENST00000265340 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.32■■■□□ 2.44
PITX1-201ENST00000265340 HFM1A2PYH4 1435 aa30.31■■■□□ 2.44
PITX1-201ENST00000265340 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
PITX1-201ENST00000265340 MIA2Q96PC5 1412 aa30.29■■■□□ 2.44
PITX1-201ENST00000265340 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
PITX1-201ENST00000265340 NAIPQ13075 1403 aa30.28■■■□□ 2.44
PITX1-201ENST00000265340 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.25■■■□□ 2.43
PITX1-201ENST00000265340 NBR1Q14596 966 aa30.25■■■□□ 2.43
PITX1-201ENST00000265340 PKNOX2Q96KN3 472 aa30.24■■■□□ 2.43
PITX1-201ENST00000265340 KIF14Q15058 1648 aa30.23■■■□□ 2.43
PITX1-201ENST00000265340 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.23■■■□□ 2.43
PITX1-201ENST00000265340 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.21■■■□□ 2.43
PITX1-201ENST00000265340 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.18■■■□□ 2.42
PITX1-201ENST00000265340 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
PITX1-201ENST00000265340 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
PITX1-201ENST00000265340 ASXL2Q76L83 1435 aa30.14■■■□□ 2.42
PITX1-201ENST00000265340 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.1■■■□□ 2.41
PITX1-201ENST00000265340 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.1■■■□□ 2.41
PITX1-201ENST00000265340 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.09■■■□□ 2.41
PITX1-201ENST00000265340 KDM6BO15054 1643 aa30.08■■■□□ 2.41
PITX1-201ENST00000265340 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
PITX1-201ENST00000265340 DAPK1P53355 1430 aa30.07■■■□□ 2.4
PITX1-201ENST00000265340 ABCC5O15440 1437 aa30.06■■■□□ 2.4
PITX1-201ENST00000265340 AKNAQ7Z591 1439 aa30.06■■■□□ 2.4
PITX1-201ENST00000265340 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
PITX1-201ENST00000265340 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
PITX1-201ENST00000265340 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.05■■■□□ 2.4
PITX1-201ENST00000265340 CCER2I3L3R5 266 aa30.04■■■□□ 2.4
PITX1-201ENST00000265340 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.42e-6■■■■□ 22.1
PITX1-201ENST00000265340 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.02■■■□□ 2.4
PITX1-201ENST00000265340 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
PITX1-201ENST00000265340 SLC24A1O60721 1099 aa30.02■■■□□ 2.4
PITX1-201ENST00000265340 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
PITX1-201ENST00000265340 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.01■■■□□ 2.39
PITX1-201ENST00000265340 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
PITX1-201ENST00000265340 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30■■■□□ 2.39
PITX1-201ENST00000265340 TRIM52Q96A61 297 aa29.99■■■□□ 2.39
PITX1-201ENST00000265340 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.96■■■□□ 2.39
PITX1-201ENST00000265340 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
PITX1-201ENST00000265340 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.94■■■□□ 2.38
PITX1-201ENST00000265340 ROCK1Q13464 1354 aa29.94■■■□□ 2.38
PITX1-201ENST00000265340 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.91■■■□□ 2.38
PITX1-201ENST00000265340 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.9■■■□□ 2.38
PITX1-201ENST00000265340 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.87■■■□□ 2.37
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.85■■■□□ 2.37
PITX1-201ENST00000265340 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.85■■■□□ 2.37
PITX1-201ENST00000265340 PREX2Q70Z35 1606 aa29.85■■■□□ 2.37
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
PITX1-201ENST00000265340 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.83■■■□□ 2.37
PITX1-201ENST00000265340 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.82■■■□□ 2.36
PITX1-201ENST00000265340 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
PITX1-201ENST00000265340 PLCH2O75038 1416 aa29.81■■■□□ 2.36
PITX1-201ENST00000265340 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.81■■■□□ 2.36
PITX1-201ENST00000265340 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.8■■■□□ 2.36
PITX1-201ENST00000265340 NCOA1Q15788 1441 aa29.8■■■□□ 2.36
PITX1-201ENST00000265340 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.8■■■□□ 2.36
PITX1-201ENST00000265340 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
PITX1-201ENST00000265340 TONSLQ96HA7 1378 aa29.79■■■□□ 2.36
PITX1-201ENST00000265340 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
PITX1-201ENST00000265340 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.77■■■□□ 2.36
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.76■■■□□ 2.36
PITX1-201ENST00000265340 CD109Q6YHK3 1445 aa29.76■■■□□ 2.35
PITX1-201ENST00000265340 ADGRL2O95490 1459 aa29.75■■■□□ 2.35
PITX1-201ENST00000265340 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
PITX1-201ENST00000265340 FOXD1Q16676 465 aa29.75■■■□□ 2.35
PITX1-201ENST00000265340 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.75■■■□□ 2.35
PITX1-201ENST00000265340 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.74■■■□□ 2.35
PITX1-201ENST00000265340 USP35Q9P2H5 1018 aa29.74■■■□□ 2.35
PITX1-201ENST00000265340 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
PITX1-201ENST00000265340 DIP2BQ9P265 1576 aa29.72■■■□□ 2.35
PITX1-201ENST00000265340 ANP32CO43423 234 aa29.7■■■□□ 2.35
PITX1-201ENST00000265340 FANCAO15360 1455 aa29.7■■■□□ 2.34
PITX1-201ENST00000265340 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.7■■■□□ 2.34
PITX1-201ENST00000265340 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.67■■■□□ 2.34
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms