RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257468.11

UBQLN1-201, Transcript of ubiquilin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN1, Length 2,299 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN1-201ENST00000257468 FOXD1Q16676 465 aa23.51■■□□□ 1.35
UBQLN1-201ENST00000257468 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
UBQLN1-201ENST00000257468 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
UBQLN1-201ENST00000257468 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.49■■□□□ 1.35
UBQLN1-201ENST00000257468 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
UBQLN1-201ENST00000257468 JPH4Q96JJ6 628 aa23.48■■□□□ 1.35
UBQLN1-201ENST00000257468 KIF14Q15058 1648 aa23.47■■□□□ 1.35
UBQLN1-201ENST00000257468 ROCK1Q13464 1354 aa23.44■■□□□ 1.34
UBQLN1-201ENST00000257468 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.44■■□□□ 1.34
UBQLN1-201ENST00000257468 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.42■■□□□ 1.34
UBQLN1-201ENST00000257468 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
UBQLN1-201ENST00000257468 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UBQLN1-201ENST00000257468 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
UBQLN1-201ENST00000257468 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.39■■□□□ 1.33
UBQLN1-201ENST00000257468 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.38■■□□□ 1.33
UBQLN1-201ENST00000257468 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.35■■□□□ 1.33
UBQLN1-201ENST00000257468 ANP32CO43423 234 aa23.35■■□□□ 1.33
UBQLN1-201ENST00000257468 CHD1O14646 1710 aa23.34■■□□□ 1.33
UBQLN1-201ENST00000257468 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.33■■□□□ 1.33
UBQLN1-201ENST00000257468 ABCA8O94911 1581 aa23.33■■□□□ 1.33
UBQLN1-201ENST00000257468 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
UBQLN1-201ENST00000257468 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
UBQLN1-201ENST00000257468 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
UBQLN1-201ENST00000257468 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.3■■□□□ 1.32
UBQLN1-201ENST00000257468 NCOA1Q15788 1441 aa23.3■■□□□ 1.32
UBQLN1-201ENST00000257468 ATP10BO94823 1461 aa23.3■■□□□ 1.32
UBQLN1-201ENST00000257468 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.29■■□□□ 1.32
UBQLN1-201ENST00000257468 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
UBQLN1-201ENST00000257468 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.28■■□□□ 1.32
UBQLN1-201ENST00000257468 CCER2I3L3R5 266 aa23.27■■□□□ 1.32
UBQLN1-201ENST00000257468 PZPP20742 1482 aa23.27■■□□□ 1.32
UBQLN1-201ENST00000257468 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.27■■□□□ 1.31
UBQLN1-201ENST00000257468 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.26■■□□□ 1.31
UBQLN1-201ENST00000257468 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.25■■□□□ 1.31
UBQLN1-201ENST00000257468 SHROOM2Q13796 1616 aa23.24■■□□□ 1.31
UBQLN1-201ENST00000257468 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.24■■□□□ 1.31
UBQLN1-201ENST00000257468 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.24■■□□□ 1.31
UBQLN1-201ENST00000257468 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
UBQLN1-201ENST00000257468 ADGRL2O95490 1459 aa23.23■■□□□ 1.31
UBQLN1-201ENST00000257468 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.18■■□□□ 1.3
UBQLN1-201ENST00000257468 PTPRGP23470 1445 aa23.18■■□□□ 1.3
UBQLN1-201ENST00000257468 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
UBQLN1-201ENST00000257468 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.15■■□□□ 1.3
UBQLN1-201ENST00000257468 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.14■■□□□ 1.3
UBQLN1-201ENST00000257468 PKD2Q13563 968 aa23.13■■□□□ 1.29
UBQLN1-201ENST00000257468 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.13■■□□□ 1.29
UBQLN1-201ENST00000257468 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.294e-6■■■□□ 15.8
UBQLN1-201ENST00000257468 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.11■■□□□ 1.29
UBQLN1-201ENST00000257468 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.09■■□□□ 1.29
UBQLN1-201ENST00000257468 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.09■■□□□ 1.29
UBQLN1-201ENST00000257468 CCDC7Q96M83 1385 aa23.08■■□□□ 1.29
UBQLN1-201ENST00000257468 NUP155O75694 1391 aa23.06■■□□□ 1.28
UBQLN1-201ENST00000257468 TSPY4P0CV99 314 aa23.06■■□□□ 1.28
UBQLN1-201ENST00000257468 TSPY10P0CW01 314 aa23.06■■□□□ 1.28
UBQLN1-201ENST00000257468 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.06■■□□□ 1.28
UBQLN1-201ENST00000257468 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.05■■□□□ 1.28
UBQLN1-201ENST00000257468 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.05■■□□□ 1.28
UBQLN1-201ENST00000257468 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.05■■□□□ 1.28
UBQLN1-201ENST00000257468 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
UBQLN1-201ENST00000257468 MBD5Q9P267 1494 aa23.05■■□□□ 1.28
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UBQLN1-201ENST00000257468 KIF15Q9NS87 1388 aa23.03■■□□□ 1.28
UBQLN1-201ENST00000257468 PREX2Q70Z35 1606 aa23.02■■□□□ 1.28
UBQLN1-201ENST00000257468 FKBP8Q14318 412 aa23.02■■□□□ 1.28
UBQLN1-201ENST00000257468 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.02■■□□□ 1.27
UBQLN1-201ENST00000257468 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.01■■□□□ 1.27
UBQLN1-201ENST00000257468 CCDC184Q52MB2 194 aa23■■□□□ 1.27
UBQLN1-201ENST00000257468 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.99■■□□□ 1.27
UBQLN1-201ENST00000257468 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
UBQLN1-201ENST00000257468 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.97■■□□□ 1.27
UBQLN1-201ENST00000257468 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
UBQLN1-201ENST00000257468 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.96■■□□□ 1.27
UBQLN1-201ENST00000257468 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.95■■□□□ 1.26
UBQLN1-201ENST00000257468 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.263e-14■□□□□ 8.3
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UBQLN1-201ENST00000257468 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.93■■□□□ 1.26
UBQLN1-201ENST00000257468 USP47Q96K76 1375 aa22.93■■□□□ 1.26
UBQLN1-201ENST00000257468 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.92■■□□□ 1.26
UBQLN1-201ENST00000257468 ABCC2Q92887 1545 aa22.91■■□□□ 1.26
UBQLN1-201ENST00000257468 KDM5CP41229 1560 aa22.89■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.88■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.88■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.88■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.87■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 NEFLP07196 543 aa22.87■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.86■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.85■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.84■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.84■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 MRS2Q9HD23 443 aa22.84■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.83■■□□□ 1.25
UBQLN1-201ENST00000257468 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.83■■□□□ 1.24
UBQLN1-201ENST00000257468 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.82■■□□□ 1.24
UBQLN1-201ENST00000257468 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.248e-9■□□□□ 9.7
UBQLN1-201ENST00000257468 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.81■■□□□ 1.24
UBQLN1-201ENST00000257468 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
UBQLN1-201ENST00000257468 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.8■■□□□ 1.24
UBQLN1-201ENST00000257468 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.8■■□□□ 1.24
UBQLN1-201ENST00000257468 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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