RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.24■■□□□ 1.31
GINS2-201ENST00000253462 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
GINS2-201ENST00000253462 KDM6BO15054 1643 aa23.23■■□□□ 1.31
GINS2-201ENST00000253462 ABCC5O15440 1437 aa23.22■■□□□ 1.31
GINS2-201ENST00000253462 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.22■■□□□ 1.31
GINS2-201ENST00000253462 SHROOM2Q13796 1616 aa23.21■■□□□ 1.31
GINS2-201ENST00000253462 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.21■■□□□ 1.31
GINS2-201ENST00000253462 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
GINS2-201ENST00000253462 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.19■■□□□ 1.3
GINS2-201ENST00000253462 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.19■■□□□ 1.3
GINS2-201ENST00000253462 AKNAQ7Z591 1439 aa23.16■■□□□ 1.3
GINS2-201ENST00000253462 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.13■■□□□ 1.29
GINS2-201ENST00000253462 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.11■■□□□ 1.29
GINS2-201ENST00000253462 ROCK1Q13464 1354 aa23.11■■□□□ 1.29
GINS2-201ENST00000253462 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.1■■□□□ 1.29
GINS2-201ENST00000253462 TONSLQ96HA7 1378 aa23.09■■□□□ 1.29
GINS2-201ENST00000253462 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
GINS2-201ENST00000253462 FOXD1Q16676 465 aa23.08■■□□□ 1.29
GINS2-201ENST00000253462 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.08■■□□□ 1.29
GINS2-201ENST00000253462 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.08■■□□□ 1.29
GINS2-201ENST00000253462 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
GINS2-201ENST00000253462 ABCC2Q92887 1545 aa23.03■■□□□ 1.28
GINS2-201ENST00000253462 NCOA1Q15788 1441 aa23.02■■□□□ 1.28
GINS2-201ENST00000253462 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
GINS2-201ENST00000253462 KCNH8Q96L42 1107 aa23.02■■□□□ 1.28
GINS2-201ENST00000253462 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GINS2-201ENST00000253462 CROCC2H7BZ55 1655 aa23■■□□□ 1.27
GINS2-201ENST00000253462 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.99■■□□□ 1.27
GINS2-201ENST00000253462 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
GINS2-201ENST00000253462 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.97■■□□□ 1.27
GINS2-201ENST00000253462 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.96■■□□□ 1.27
GINS2-201ENST00000253462 TSPY4P0CV99 314 aa22.95■■□□□ 1.26
GINS2-201ENST00000253462 TSPY10P0CW01 314 aa22.95■■□□□ 1.26
GINS2-201ENST00000253462 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.94■■□□□ 1.26
GINS2-201ENST00000253462 ADGRL2O95490 1459 aa22.93■■□□□ 1.26
GINS2-201ENST00000253462 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.93■■□□□ 1.26
GINS2-201ENST00000253462 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
GINS2-201ENST00000253462 PREX2Q70Z35 1606 aa22.92■■□□□ 1.26
GINS2-201ENST00000253462 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.91■■□□□ 1.26
GINS2-201ENST00000253462 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
GINS2-201ENST00000253462 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.89■■□□□ 1.26
GINS2-201ENST00000253462 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.89■■□□□ 1.25
GINS2-201ENST00000253462 MBD5Q9P267 1494 aa22.88■■□□□ 1.25
GINS2-201ENST00000253462 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.87■■□□□ 1.25
GINS2-201ENST00000253462 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.87■■□□□ 1.25
GINS2-201ENST00000253462 PZPP20742 1482 aa22.86■■□□□ 1.25
GINS2-201ENST00000253462 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
GINS2-201ENST00000253462 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.85■■□□□ 1.25
GINS2-201ENST00000253462 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.85■■□□□ 1.25
GINS2-201ENST00000253462 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.85■■□□□ 1.25
GINS2-201ENST00000253462 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.83■■□□□ 1.25
GINS2-201ENST00000253462 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.83■■□□□ 1.25
GINS2-201ENST00000253462 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.83■■□□□ 1.25
GINS2-201ENST00000253462 KIF15Q9NS87 1388 aa22.82■■□□□ 1.24
GINS2-201ENST00000253462 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.82■■□□□ 1.24
GINS2-201ENST00000253462 PKD2Q13563 968 aa22.81■■□□□ 1.24
GINS2-201ENST00000253462 NUP155O75694 1391 aa22.79■■□□□ 1.24
GINS2-201ENST00000253462 OSCARQ8IYS5 282 aa22.79■■□□□ 1.24
GINS2-201ENST00000253462 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
GINS2-201ENST00000253462 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.77■■□□□ 1.24
GINS2-201ENST00000253462 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
GINS2-201ENST00000253462 PLCH2O75038 1416 aa22.74■■□□□ 1.23
GINS2-201ENST00000253462 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.74■■□□□ 1.23
GINS2-201ENST00000253462 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.73■■□□□ 1.23
GINS2-201ENST00000253462 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.72■■□□□ 1.23
GINS2-201ENST00000253462 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.69■■□□□ 1.22
GINS2-201ENST00000253462 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.69■■□□□ 1.22
GINS2-201ENST00000253462 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
GINS2-201ENST00000253462 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.67■■□□□ 1.22
GINS2-201ENST00000253462 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.225e-6■■■□□ 16.1
GINS2-201ENST00000253462 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.66■■□□□ 1.22
GINS2-201ENST00000253462 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.63■■□□□ 1.21
GINS2-201ENST00000253462 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.63■■□□□ 1.21
GINS2-201ENST00000253462 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
GINS2-201ENST00000253462 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
GINS2-201ENST00000253462 AFAP1Q8N556 730 aa22.62■■□□□ 1.21
GINS2-201ENST00000253462 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.61■■□□□ 1.21
GINS2-201ENST00000253462 ABCC1P33527 1531 aa22.61■■□□□ 1.21
GINS2-201ENST00000253462 ASXL2Q76L83 1435 aa22.6■■□□□ 1.21
GINS2-201ENST00000253462 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.59■■□□□ 1.21
GINS2-201ENST00000253462 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
GINS2-201ENST00000253462 PLXNC1O60486 1568 aa22.57■■□□□ 1.2
GINS2-201ENST00000253462 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
GINS2-201ENST00000253462 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.54■■□□□ 1.2
GINS2-201ENST00000253462 FANCAO15360 1455 aa22.54■■□□□ 1.2
GINS2-201ENST00000253462 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.53■■□□□ 1.2
GINS2-201ENST00000253462 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.52■■□□□ 1.2
GINS2-201ENST00000253462 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.52■■□□□ 1.2
GINS2-201ENST00000253462 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.52■■□□□ 1.2
GINS2-201ENST00000253462 ANP32CO43423 234 aa22.51■■□□□ 1.19
GINS2-201ENST00000253462 UNC13BO14795 1591 aa22.51■■□□□ 1.19
GINS2-201ENST00000253462 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.5■■□□□ 1.19
GINS2-201ENST00000253462 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
GINS2-201ENST00000253462 BCANQ96GW7 911 aa22.49■■□□□ 1.19
GINS2-201ENST00000253462 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.47■■□□□ 1.19
GINS2-201ENST00000253462 ERBINQ96RT1 1412 aa22.47■■□□□ 1.19
GINS2-201ENST00000253462 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.46■■□□□ 1.19
GINS2-201ENST00000253462 ADGRL1O94910 1474 aa22.46■■□□□ 1.19
GINS2-201ENST00000253462 RGL3Q3MIN7 710 aa22.45■■□□□ 1.18
GINS2-201ENST00000253462 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.44■■□□□ 1.18
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