RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251630.10

PDGFRL-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PDGFRL, Length 1,901 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRL-201ENST00000251630 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.21■■□□□ 1.15
PDGFRL-201ENST00000251630 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.2■■□□□ 1.14
PDGFRL-201ENST00000251630 ROCK1Q13464 1354 aa22.2■■□□□ 1.14
PDGFRL-201ENST00000251630 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.19■■□□□ 1.14
PDGFRL-201ENST00000251630 KDM6BO15054 1643 aa22.16■■□□□ 1.14
PDGFRL-201ENST00000251630 OSCARQ8IYS5 282 aa22.16■■□□□ 1.14
PDGFRL-201ENST00000251630 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PDGFRL-201ENST00000251630 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PDGFRL-201ENST00000251630 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
PDGFRL-201ENST00000251630 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.11■■□□□ 1.13
PDGFRL-201ENST00000251630 PREX2Q70Z35 1606 aa22.1■■□□□ 1.13
PDGFRL-201ENST00000251630 ADGRL2O95490 1459 aa22.09■■□□□ 1.13
PDGFRL-201ENST00000251630 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.09■■□□□ 1.13
PDGFRL-201ENST00000251630 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
PDGFRL-201ENST00000251630 NCOA1Q15788 1441 aa22.08■■□□□ 1.12
PDGFRL-201ENST00000251630 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.07■■□□□ 1.12
PDGFRL-201ENST00000251630 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.07■■□□□ 1.12
PDGFRL-201ENST00000251630 MBD5Q9P267 1494 aa22.07■■□□□ 1.12
PDGFRL-201ENST00000251630 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.06■■□□□ 1.12
PDGFRL-201ENST00000251630 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.05■■□□□ 1.12
PDGFRL-201ENST00000251630 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PDGFRL-201ENST00000251630 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.03■■□□□ 1.12
PDGFRL-201ENST00000251630 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.03■■□□□ 1.12
PDGFRL-201ENST00000251630 KCNH8Q96L42 1107 aa22■■□□□ 1.11
PDGFRL-201ENST00000251630 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.99■■□□□ 1.11
PDGFRL-201ENST00000251630 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
PDGFRL-201ENST00000251630 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.98■■□□□ 1.11
PDGFRL-201ENST00000251630 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.97■■□□□ 1.11
PDGFRL-201ENST00000251630 PLCH2O75038 1416 aa21.97■■□□□ 1.11
PDGFRL-201ENST00000251630 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.97■■□□□ 1.11
PDGFRL-201ENST00000251630 NEUROD1Q13562 356 aa21.96■■□□□ 1.11
PDGFRL-201ENST00000251630 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.96■■□□□ 1.11
PDGFRL-201ENST00000251630 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.96■■□□□ 1.11
PDGFRL-201ENST00000251630 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.95■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 TRIM52Q96A61 297 aa21.95■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.94■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.94■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.94■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.91■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.9■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.9■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.9■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 TSPY4P0CV99 314 aa21.9■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 TSPY10P0CW01 314 aa21.9■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 PZPP20742 1482 aa21.89■■□□□ 1.1
PDGFRL-201ENST00000251630 ASXL2Q76L83 1435 aa21.89■■□□□ 1.09
PDGFRL-201ENST00000251630 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.88■■□□□ 1.09
PDGFRL-201ENST00000251630 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PDGFRL-201ENST00000251630 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.88■■□□□ 1.09
PDGFRL-201ENST00000251630 KIF15Q9NS87 1388 aa21.86■■□□□ 1.09
PDGFRL-201ENST00000251630 ABCC1P33527 1531 aa21.85■■□□□ 1.09
PDGFRL-201ENST00000251630 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PDGFRL-201ENST00000251630 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.84■■□□□ 1.09
PDGFRL-201ENST00000251630 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.84■■□□□ 1.09
PDGFRL-201ENST00000251630 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.83■■□□□ 1.09
PDGFRL-201ENST00000251630 FOXD1Q16676 465 aa21.82■■□□□ 1.08
PDGFRL-201ENST00000251630 TONSLQ96HA7 1378 aa21.81■■□□□ 1.08
PDGFRL-201ENST00000251630 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PDGFRL-201ENST00000251630 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.79■■□□□ 1.08
PDGFRL-201ENST00000251630 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.78■■□□□ 1.08
PDGFRL-201ENST00000251630 PLXNC1O60486 1568 aa21.78■■□□□ 1.08
PDGFRL-201ENST00000251630 FANCAO15360 1455 aa21.74■■□□□ 1.07
PDGFRL-201ENST00000251630 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PDGFRL-201ENST00000251630 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
PDGFRL-201ENST00000251630 NUP155O75694 1391 aa21.72■■□□□ 1.07
PDGFRL-201ENST00000251630 PKD2Q13563 968 aa21.69■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.69■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.68■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.67■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.67■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 AFAP1Q8N556 730 aa21.67■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 UNC13BO14795 1591 aa21.67■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.66■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.66■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.66■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.65■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 ERBINQ96RT1 1412 aa21.65■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 ADGRL1O94910 1474 aa21.65■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.65■■□□□ 1.06
PDGFRL-201ENST00000251630 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PDGFRL-201ENST00000251630 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.63■■□□□ 1.05
PDGFRL-201ENST00000251630 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.63■■□□□ 1.05
PDGFRL-201ENST00000251630 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PDGFRL-201ENST00000251630 CD109Q6YHK3 1445 aa21.61■■□□□ 1.05
PDGFRL-201ENST00000251630 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.61■■□□□ 1.05
PDGFRL-201ENST00000251630 ATP7AQ04656 1500 aa21.58■■□□□ 1.05
PDGFRL-201ENST00000251630 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.57■■□□□ 1.04
PDGFRL-201ENST00000251630 MIER1Q8N108 512 aa21.55■■□□□ 1.04
PDGFRL-201ENST00000251630 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.53■■□□□ 1.04
PDGFRL-201ENST00000251630 PLA2R1Q13018 1463 aa21.52■■□□□ 1.04
PDGFRL-201ENST00000251630 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.52■■□□□ 1.04
PDGFRL-201ENST00000251630 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.52■■□□□ 1.03
PDGFRL-201ENST00000251630 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
PDGFRL-201ENST00000251630 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.51■■□□□ 1.03
PDGFRL-201ENST00000251630 KDM5CP41229 1560 aa21.5■■□□□ 1.03
PDGFRL-201ENST00000251630 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PDGFRL-201ENST00000251630 NEO1Q92859 1461 aa21.49■■□□□ 1.03
PDGFRL-201ENST00000251630 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.49■■□□□ 1.03
PDGFRL-201ENST00000251630 DEPDC5O75140 1603 aa21.48■■□□□ 1.03
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