RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000245157.9

BBS2-201, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BBS2, Length 2,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-201ENST00000245157 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
BBS2-201ENST00000245157 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
BBS2-201ENST00000245157 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.38■□□□□ 0.85
BBS2-201ENST00000245157 MSH5O43196 834 aa20.37■□□□□ 0.85
BBS2-201ENST00000245157 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.37■□□□□ 0.85
BBS2-201ENST00000245157 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.36■□□□□ 0.85
BBS2-201ENST00000245157 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.35■□□□□ 0.85
BBS2-201ENST00000245157 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.34■□□□□ 0.85
BBS2-201ENST00000245157 PKD2Q13563 968 aa20.33■□□□□ 0.85
BBS2-201ENST00000245157 ARHGEF11O15085 1522 aa20.33■□□□□ 0.85
BBS2-201ENST00000245157 IQGAP2Q13576 1575 aa20.33■□□□□ 0.85
BBS2-201ENST00000245157 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 ABCC5O15440 1437 aa20.32■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 DAPK1P53355 1430 aa20.32■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 HECW1Q76N89 1606 aa20.32■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 MIA2Q96PC5 1412 aa20.32■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.31■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.3■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 NCOA1Q15788 1441 aa20.28■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
BBS2-201ENST00000245157 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
BBS2-201ENST00000245157 WDR62O43379 1518 aa20.23■□□□□ 0.83
BBS2-201ENST00000245157 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.22■□□□□ 0.83
BBS2-201ENST00000245157 AKNAQ7Z591 1439 aa20.21■□□□□ 0.83
BBS2-201ENST00000245157 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.2■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.2■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 TMC1Q8TDI8 760 aa20.2■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 USP47Q96K76 1375 aa20.19■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 ROCK1Q13464 1354 aa20.18■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.18■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.17■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 ADAMTS12P58397 1594 aa20.17■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.17■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 PBRM1Q86U86 1689 aa20.17■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 DISP1Q96F81 1524 aa20.16■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 NUP155O75694 1391 aa20.16■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.16■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 RGL3Q3MIN7 710 aa20.16■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 JPH4Q96JJ6 628 aa20.16■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.15■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.15■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.15■□□□□ 0.82
BBS2-201ENST00000245157 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.14■□□□□ 0.81
BBS2-201ENST00000245157 TSPY4P0CV99 314 aa20.13■□□□□ 0.81
BBS2-201ENST00000245157 TSPY10P0CW01 314 aa20.13■□□□□ 0.81
BBS2-201ENST00000245157 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.12■□□□□ 0.81
BBS2-201ENST00000245157 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.813e-6■□□□□ 10.3
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BBS2-201ENST00000245157 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.1■□□□□ 0.81
BBS2-201ENST00000245157 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.1■□□□□ 0.81
BBS2-201ENST00000245157 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
BBS2-201ENST00000245157 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.09■□□□□ 0.81
BBS2-201ENST00000245157 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.09■□□□□ 0.81
BBS2-201ENST00000245157 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.08■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.07■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 NUDCQ9Y266 331 aa20.07■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 KIAA0556O60303 1618 aa20.07■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 BCL11AQ9H165 835 aa20.06■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 GRIN2AQ12879 1464 aa20.06■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 IFT140Q96RY7 1462 aa20.05■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.03■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 NBR1Q14596 966 aa20.03■□□□□ 0.8
BBS2-201ENST00000245157 ERCC6Q03468 1493 aa20■□□□□ 0.79
BBS2-201ENST00000245157 KIF14Q15058 1648 aa19.99■□□□□ 0.79
BBS2-201ENST00000245157 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.99■□□□□ 0.79
BBS2-201ENST00000245157 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
BBS2-201ENST00000245157 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
BBS2-201ENST00000245157 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.96■□□□□ 0.79
BBS2-201ENST00000245157 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.96■□□□□ 0.79
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BBS2-201ENST00000245157 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
BBS2-201ENST00000245157 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
BBS2-201ENST00000245157 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.94■□□□□ 0.78
BBS2-201ENST00000245157 KIF15Q9NS87 1388 aa19.94■□□□□ 0.78
BBS2-201ENST00000245157 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.91■□□□□ 0.78
BBS2-201ENST00000245157 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.91■□□□□ 0.78
BBS2-201ENST00000245157 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
BBS2-201ENST00000245157 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
BBS2-201ENST00000245157 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
BBS2-201ENST00000245157 PLIN1O60240 522 aa19.88■□□□□ 0.77
BBS2-201ENST00000245157 MBD5Q9P267 1494 aa19.88■□□□□ 0.77
BBS2-201ENST00000245157 CEP170Q5SW79 1584 aa19.87■□□□□ 0.77
BBS2-201ENST00000245157 ATP10BO94823 1461 aa19.87■□□□□ 0.77
BBS2-201ENST00000245157 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.86■□□□□ 0.77
BBS2-201ENST00000245157 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
BBS2-201ENST00000245157 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
BBS2-201ENST00000245157 RALBP1Q15311 655 aa19.85■□□□□ 0.77
BBS2-201ENST00000245157 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
BBS2-201ENST00000245157 SYNJ2O15056 1496 aa19.84■□□□□ 0.77
BBS2-201ENST00000245157 SKAP1Q86WV1 359 aa19.84■□□□□ 0.77
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