RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 USP35Q9P2H5 1018 aa12.94□□□□□ -0.34
TTL-201ENST00000233336 NUDCQ9Y266 331 aa12.94□□□□□ -0.34
TTL-201ENST00000233336 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TTL-201ENST00000233336 KCNH8Q96L42 1107 aa12.93□□□□□ -0.34
TTL-201ENST00000233336 KCNJ4P48050 445 aa12.92□□□□□ -0.34
TTL-201ENST00000233336 FANCIQ9NVI1 1328 aa12.92□□□□□ -0.34
TTL-201ENST00000233336 DCAF11Q8TEB1 546 aa12.92□□□□□ -0.34
TTL-201ENST00000233336 TMF1P82094 1093 aa12.92□□□□□ -0.34
TTL-201ENST00000233336 FGD1P98174 961 aa12.91□□□□□ -0.34
TTL-201ENST00000233336 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
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TTL-201ENST00000233336 MCCP23508 829 aa12.9□□□□□ -0.34
TTL-201ENST00000233336 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.9□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 C14orf37Q86TY3 774 aa12.89□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.88□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 GSE1Q14687 1217 aa12.88□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 RALBP1Q15311 655 aa12.87□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 FOXD1Q16676 465 aa12.87□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 CFAP44Q96MT7 982 aa12.87□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 PLEKHG5O94827 1062 aa12.86□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 CECR2Q9BXF3 1484 aa12.85□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.84□□□□□ -0.35
TTL-201ENST00000233336 MORC1Q86VD1 984 aa12.83□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 ITPRIPQ8IWB1 547 aa12.83□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 PDE4AP27815 886 aa12.82□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa12.82□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 CUX2O14529 1486 aa12.82□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 APBB1O00213 710 aa12.81□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 A0A0G2JS52 829 aa12.81□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 DDX11L8A8MPP1 907 aa12.81□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 ZBED9Q6R2W3 1325 aa12.8□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 POGKQ9P215 609 aa12.8□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 MROH2BQ7Z745 1585 aa12.8□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 SLC4A3P48751 1232 aa12.79□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.79□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.78□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 FMN1Q68DA7 1419 aa12.78□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa12.78□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 PDE3BQ13370 1112 aa12.77□□□□□ -0.36
TTL-201ENST00000233336 FAM161AQ3B820 660 aa12.77□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.77□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 PKD2Q13563 968 aa12.77□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 PHF14O94880 888 aa12.76□□□□□ -0.37
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TTL-201ENST00000233336 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.76□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 KIF15Q9NS87 1388 aa12.75□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 GOLGA2Q08379 1002 aa12.75□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 NLRP13Q86W25 1043 aa12.74□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 RRP1P56182 461 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa12.73□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 KANK1Q14678 1352 aa12.73□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 SMC4Q9NTJ3 1288 aa12.72□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.72□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 CCDC146Q8IYE0 955 aa12.72□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 EXOC6Q8TAG9 804 aa12.71□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.71□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 PLIN1O60240 522 aa12.71□□□□□ -0.37
TTL-201ENST00000233336 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa12.71□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 CALRP27797 417 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 CRBNQ96SW2 442 aa12.7□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 SETQ01105 290 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 CCDC18Q5T9S5 1454 aa12.7□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 FAM13BQ9NYF5 915 aa12.69□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 CLUAP1Q96AJ1 413 aa12.69□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa12.69□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 ST18O60284 1047 aa12.68□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 NUP155O75694 1391 aa12.68□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
TTL-201ENST00000233336 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
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