RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000212015.10

SIRT1-201, Transcript of sirtuin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIRT1, Length 4,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1-201ENST00000212015 TSPY4P0CV99 314 aa23.12■■□□□ 1.29
SIRT1-201ENST00000212015 TSPY10P0CW01 314 aa23.12■■□□□ 1.29
SIRT1-201ENST00000212015 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SIRT1-201ENST00000212015 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SIRT1-201ENST00000212015 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.11■■□□□ 1.29
SIRT1-201ENST00000212015 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.09■■□□□ 1.29
SIRT1-201ENST00000212015 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SIRT1-201ENST00000212015 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.09■■□□□ 1.29
SIRT1-201ENST00000212015 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SIRT1-201ENST00000212015 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.07■■□□□ 1.28
SIRT1-201ENST00000212015 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.07■■□□□ 1.28
SIRT1-201ENST00000212015 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.06■■□□□ 1.28
SIRT1-201ENST00000212015 CRBNQ96SW2 442 aa23.06■■□□□ 1.28
SIRT1-201ENST00000212015 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SIRT1-201ENST00000212015 UACAQ9BZF9 1416 aa23.06■■□□□ 1.28
SIRT1-201ENST00000212015 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SIRT1-201ENST00000212015 GSE1Q14687 1217 aa23.05■■□□□ 1.28
SIRT1-201ENST00000212015 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SIRT1-201ENST00000212015 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SIRT1-201ENST00000212015 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.99■■□□□ 1.27
SIRT1-201ENST00000212015 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.98■■□□□ 1.27
SIRT1-201ENST00000212015 NFKBIBQ15653 356 aa22.98■■□□□ 1.27
SIRT1-201ENST00000212015 BECN1Q14457 450 aa22.97■■□□□ 1.27
SIRT1-201ENST00000212015 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.97■■□□□ 1.27
SIRT1-201ENST00000212015 CUX1P39880 1505 aa22.97■■□□□ 1.27
SIRT1-201ENST00000212015 USP47Q96K76 1375 aa22.97■■□□□ 1.27
SIRT1-201ENST00000212015 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.95■■□□□ 1.26
SIRT1-201ENST00000212015 USP35Q9P2H5 1018 aa22.94■■□□□ 1.26
SIRT1-201ENST00000212015 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.94■■□□□ 1.26
SIRT1-201ENST00000212015 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SIRT1-201ENST00000212015 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.93■■□□□ 1.26
SIRT1-201ENST00000212015 NCAPD3P42695 1498 aa22.93■■□□□ 1.26
SIRT1-201ENST00000212015 TIAM1Q13009 1591 aa22.93■■□□□ 1.26
SIRT1-201ENST00000212015 NLRP13Q86W25 1043 aa22.92■■□□□ 1.26
SIRT1-201ENST00000212015 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SIRT1-201ENST00000212015 RALBP1Q15311 655 aa22.9■■□□□ 1.26
SIRT1-201ENST00000212015 TOP2BQ02880 1626 aa22.89■■□□□ 1.26
SIRT1-201ENST00000212015 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SIRT1-201ENST00000212015 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SIRT1-201ENST00000212015 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SIRT1-201ENST00000212015 BACH2Q9BYV9 841 aa22.88■■□□□ 1.25
SIRT1-201ENST00000212015 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SIRT1-201ENST00000212015 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.87■■□□□ 1.25
SIRT1-201ENST00000212015 NUP155O75694 1391 aa22.87■■□□□ 1.25
SIRT1-201ENST00000212015 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.86■■□□□ 1.25
SIRT1-201ENST00000212015 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SIRT1-201ENST00000212015 CFTRP13569 1480 aa22.84■■□□□ 1.25
SIRT1-201ENST00000212015 NAIPQ13075 1403 aa22.82■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.82■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.82■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.81■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 PANK3Q9H999 370 aa22.81■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 KIF15Q9NS87 1388 aa22.81■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 HFM1A2PYH4 1435 aa22.8■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 NESP48681 1621 aa22.8■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 NCOA2Q15596 1464 aa22.8■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 FAM161AQ3B820 660 aa22.79■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 MS4A1P11836 297 aa22.79■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 TMF1P82094 1093 aa22.77■■□□□ 1.24
SIRT1-201ENST00000212015 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
SIRT1-201ENST00000212015 PTPRKQ15262 1439 aa22.76■■□□□ 1.23
SIRT1-201ENST00000212015 PDE3BQ13370 1112 aa22.76■■□□□ 1.23
SIRT1-201ENST00000212015 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.76■■□□□ 1.23
SIRT1-201ENST00000212015 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.236e-8■■■■■ 36.8
SIRT1-201ENST00000212015 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.75■■□□□ 1.23
SIRT1-201ENST00000212015 GOLGA2Q08379 1002 aa22.74■■□□□ 1.23
SIRT1-201ENST00000212015 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SIRT1-201ENST00000212015 ARID3AQ99856 593 aa22.73■■□□□ 1.23
SIRT1-201ENST00000212015 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.72■■□□□ 1.23
SIRT1-201ENST00000212015 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SIRT1-201ENST00000212015 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 COG6Q9Y2V7 657 aa22.7■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.7■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.69■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.68■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.67■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 APAF1O14727 1248 aa22.67■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.67■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.65■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
SIRT1-201ENST00000212015 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.64■■□□□ 1.21
SIRT1-201ENST00000212015 NCOA1Q15788 1441 aa22.62■■□□□ 1.21
SIRT1-201ENST00000212015 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.62■■□□□ 1.21
SIRT1-201ENST00000212015 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.6■■□□□ 1.21
SIRT1-201ENST00000212015 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.59■■□□□ 1.21
SIRT1-201ENST00000212015 POGKQ9P215 609 aa22.59■■□□□ 1.21
SIRT1-201ENST00000212015 PANK1Q8TE04 598 aa22.58■■□□□ 1.21
SIRT1-201ENST00000212015 SLC24A1O60721 1099 aa22.57■■□□□ 1.2
SIRT1-201ENST00000212015 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SIRT1-201ENST00000212015 BCAR3O75815 825 aa22.57■■□□□ 1.2
SIRT1-201ENST00000212015 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.56■■□□□ 1.2
SIRT1-201ENST00000212015 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms