RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000188376.9

SLC25A3-201, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-201ENST00000188376 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.46■■■□□ 2.15
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCC5O15440 1437 aa28.43■■■□□ 2.14
SLC25A3-201ENST00000188376 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.42■■■□□ 2.14
SLC25A3-201ENST00000188376 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.143e-6■□□□□ 8.9
SLC25A3-201ENST00000188376 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.4■■■□□ 2.14
SLC25A3-201ENST00000188376 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.39■■■□□ 2.14
SLC25A3-201ENST00000188376 KCNH8Q96L42 1107 aa28.39■■■□□ 2.13
SLC25A3-201ENST00000188376 AKNAQ7Z591 1439 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC25A3-201ENST00000188376 PREX2Q70Z35 1606 aa28.38■■■□□ 2.13
SLC25A3-201ENST00000188376 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.37■■■□□ 2.13
SLC25A3-201ENST00000188376 MAPKBP1O60336 1514 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC25A3-201ENST00000188376 ROCK1Q13464 1354 aa28.33■■■□□ 2.12
SLC25A3-201ENST00000188376 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.32■■■□□ 2.12
SLC25A3-201ENST00000188376 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.31■■■□□ 2.12
SLC25A3-201ENST00000188376 KDM6BO15054 1643 aa28.28■■■□□ 2.12
SLC25A3-201ENST00000188376 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.28■■■□□ 2.12
SLC25A3-201ENST00000188376 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.27■■■□□ 2.12
SLC25A3-201ENST00000188376 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.26■■■□□ 2.12
SLC25A3-201ENST00000188376 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.25■■■□□ 2.11
SLC25A3-201ENST00000188376 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
SLC25A3-201ENST00000188376 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.21■■■□□ 2.11
SLC25A3-201ENST00000188376 NCOA1Q15788 1441 aa28.2■■■□□ 2.11
SLC25A3-201ENST00000188376 ADGRL2O95490 1459 aa28.2■■■□□ 2.1
SLC25A3-201ENST00000188376 MBD5Q9P267 1494 aa28.2■■■□□ 2.1
SLC25A3-201ENST00000188376 PLCH2O75038 1416 aa28.19■■■□□ 2.1
SLC25A3-201ENST00000188376 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.19■■■□□ 2.1
SLC25A3-201ENST00000188376 ASXL2Q76L83 1435 aa28.18■■■□□ 2.1
SLC25A3-201ENST00000188376 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.12e-87■■□□□ 14.2
SLC25A3-201ENST00000188376 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.17■■■□□ 2.1
SLC25A3-201ENST00000188376 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.16■■■□□ 2.1
SLC25A3-201ENST00000188376 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.15■■■□□ 2.1
SLC25A3-201ENST00000188376 TSPY4P0CV99 314 aa28.15■■■□□ 2.1
SLC25A3-201ENST00000188376 TSPY10P0CW01 314 aa28.15■■■□□ 2.1
SLC25A3-201ENST00000188376 TRIM52Q96A61 297 aa28.15■■■□□ 2.1
SLC25A3-201ENST00000188376 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.15■■■□□ 2.1
SLC25A3-201ENST00000188376 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.11■■■□□ 2.09
SLC25A3-201ENST00000188376 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.1■■■□□ 2.09
SLC25A3-201ENST00000188376 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.1■■■□□ 2.09
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.1■■■□□ 2.09
SLC25A3-201ENST00000188376 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.1■■■□□ 2.09
SLC25A3-201ENST00000188376 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC25A3-201ENST00000188376 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC25A3-201ENST00000188376 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC25A3-201ENST00000188376 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC25A3-201ENST00000188376 NEUROD1Q13562 356 aa28.07■■■□□ 2.08
SLC25A3-201ENST00000188376 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.06■■■□□ 2.08
SLC25A3-201ENST00000188376 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.05■■■□□ 2.08
SLC25A3-201ENST00000188376 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
SLC25A3-201ENST00000188376 ABCC1P33527 1531 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC25A3-201ENST00000188376 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
SLC25A3-201ENST00000188376 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.03■■■□□ 2.08
SLC25A3-201ENST00000188376 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC25A3-201ENST00000188376 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.02■■■□□ 2.08
SLC25A3-201ENST00000188376 KIF15Q9NS87 1388 aa28.01■■■□□ 2.07
SLC25A3-201ENST00000188376 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28■■■□□ 2.07
SLC25A3-201ENST00000188376 FANCAO15360 1455 aa27.97■■■□□ 2.07
SLC25A3-201ENST00000188376 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.94■■■□□ 2.06
SLC25A3-201ENST00000188376 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SLC25A3-201ENST00000188376 PZPP20742 1482 aa27.91■■■□□ 2.06
SLC25A3-201ENST00000188376 FOXD1Q16676 465 aa27.9■■■□□ 2.06
SLC25A3-201ENST00000188376 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.9■■■□□ 2.06
SLC25A3-201ENST00000188376 PLXNC1O60486 1568 aa27.9■■■□□ 2.06
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
SLC25A3-201ENST00000188376 CD109Q6YHK3 1445 aa27.86■■■□□ 2.05
SLC25A3-201ENST00000188376 ADGRL1O94910 1474 aa27.86■■■□□ 2.05
SLC25A3-201ENST00000188376 AFAP1Q8N556 730 aa27.85■■■□□ 2.05
SLC25A3-201ENST00000188376 TONSLQ96HA7 1378 aa27.85■■■□□ 2.05
SLC25A3-201ENST00000188376 NUP155O75694 1391 aa27.83■■■□□ 2.05
SLC25A3-201ENST00000188376 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.82■■■□□ 2.04
SLC25A3-201ENST00000188376 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
SLC25A3-201ENST00000188376 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.8■■■□□ 2.04
SLC25A3-201ENST00000188376 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.8■■■□□ 2.04
SLC25A3-201ENST00000188376 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.79■■■□□ 2.04
SLC25A3-201ENST00000188376 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.79■■■□□ 2.04
SLC25A3-201ENST00000188376 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.77■■■□□ 2.04
SLC25A3-201ENST00000188376 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.77■■■□□ 2.04
SLC25A3-201ENST00000188376 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
SLC25A3-201ENST00000188376 PKD2Q13563 968 aa27.75■■■□□ 2.03
SLC25A3-201ENST00000188376 ERBINQ96RT1 1412 aa27.73■■■□□ 2.03
SLC25A3-201ENST00000188376 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
SLC25A3-201ENST00000188376 ATP7AQ04656 1500 aa27.73■■■□□ 2.03
SLC25A3-201ENST00000188376 UNC13BO14795 1591 aa27.73■■■□□ 2.03
SLC25A3-201ENST00000188376 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.69■■■□□ 2.02
SLC25A3-201ENST00000188376 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.69■■■□□ 2.02
SLC25A3-201ENST00000188376 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
SLC25A3-201ENST00000188376 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.69■■■□□ 2.02
SLC25A3-201ENST00000188376 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.68■■■□□ 2.02
SLC25A3-201ENST00000188376 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
SLC25A3-201ENST00000188376 GLI2P10070 1586 aa27.67■■■□□ 2.02
SLC25A3-201ENST00000188376 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.67■■■□□ 2.02
SLC25A3-201ENST00000188376 NEO1Q92859 1461 aa27.64■■■□□ 2.02
SLC25A3-201ENST00000188376 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.63■■■□□ 2.01
SLC25A3-201ENST00000188376 DIP2BQ9P265 1576 aa27.62■■■□□ 2.01
SLC25A3-201ENST00000188376 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.62■■■□□ 2.01
SLC25A3-201ENST00000188376 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.62■■■□□ 2.01
SLC25A3-201ENST00000188376 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.61■■■□□ 2.01
SLC25A3-201ENST00000188376 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.61■■■□□ 2.01
SLC25A3-201ENST00000188376 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.59■■■□□ 2.01
SLC25A3-201ENST00000188376 KDM5CP41229 1560 aa27.59■■■□□ 2.01
SLC25A3-201ENST00000188376 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.56■■■□□ 2
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