RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.21■■□□□ 1.95
SIKE1-201ENST00000060969 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.21■■□□□ 1.95
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
SIKE1-201ENST00000060969 AKNAQ7Z591 1439 aa27.2■■□□□ 1.94
SIKE1-201ENST00000060969 ABCC2Q92887 1545 aa27.19■■□□□ 1.94
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SIKE1-201ENST00000060969 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.02■■□□□ 1.92
SIKE1-201ENST00000060969 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SIKE1-201ENST00000060969 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.02■■□□□ 1.92
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SIKE1-201ENST00000060969 ADGRL2O95490 1459 aa26.96■■□□□ 1.91
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SIKE1-201ENST00000060969 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.85■■□□□ 1.89
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SIKE1-201ENST00000060969 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.83■■□□□ 1.88
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SIKE1-201ENST00000060969 KIF15Q9NS87 1388 aa26.77■■□□□ 1.88
SIKE1-201ENST00000060969 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.75■■□□□ 1.87
SIKE1-201ENST00000060969 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.74■■□□□ 1.87
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SIKE1-201ENST00000060969 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.71■■□□□ 1.87
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SIKE1-201ENST00000060969 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.67■■□□□ 1.86
SIKE1-201ENST00000060969 ASXL2Q76L83 1435 aa26.67■■□□□ 1.86
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SIKE1-201ENST00000060969 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SIKE1-201ENST00000060969 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.61■■□□□ 1.85
SIKE1-201ENST00000060969 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.61■■□□□ 1.85
SIKE1-201ENST00000060969 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.61■■□□□ 1.85
SIKE1-201ENST00000060969 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.59■■□□□ 1.85
SIKE1-201ENST00000060969 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.59■■□□□ 1.85
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SIKE1-201ENST00000060969 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SIKE1-201ENST00000060969 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.56■■□□□ 1.84
SIKE1-201ENST00000060969 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
SIKE1-201ENST00000060969 FANCAO15360 1455 aa26.54■■□□□ 1.84
SIKE1-201ENST00000060969 AFAP1Q8N556 730 aa26.52■■□□□ 1.84
SIKE1-201ENST00000060969 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.5■■□□□ 1.83
SIKE1-201ENST00000060969 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.49■■□□□ 1.83
SIKE1-201ENST00000060969 UNC13BO14795 1591 aa26.48■■□□□ 1.83
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SIKE1-201ENST00000060969 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.46■■□□□ 1.83
SIKE1-201ENST00000060969 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
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SIKE1-201ENST00000060969 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.44■■□□□ 1.82
SIKE1-201ENST00000060969 ADGRL1O94910 1474 aa26.44■■□□□ 1.82
SIKE1-201ENST00000060969 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
SIKE1-201ENST00000060969 ERBINQ96RT1 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
SIKE1-201ENST00000060969 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.41■■□□□ 1.82
SIKE1-201ENST00000060969 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.39■■□□□ 1.82
SIKE1-201ENST00000060969 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.38■■□□□ 1.81
SIKE1-201ENST00000060969 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SIKE1-201ENST00000060969 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SIKE1-201ENST00000060969 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.36■■□□□ 1.81
SIKE1-201ENST00000060969 ATP7AQ04656 1500 aa26.36■■□□□ 1.81
SIKE1-201ENST00000060969 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.36■■□□□ 1.81
SIKE1-201ENST00000060969 CD109Q6YHK3 1445 aa26.36■■□□□ 1.81
SIKE1-201ENST00000060969 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
SIKE1-201ENST00000060969 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.33■■□□□ 1.81
SIKE1-201ENST00000060969 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.33■■□□□ 1.81
SIKE1-201ENST00000060969 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.33■■□□□ 1.81
SIKE1-201ENST00000060969 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.3■■□□□ 1.8
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