RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176325.7

Apobec3-209, Transcript of DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Apobec3, Length 2,765 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Fyco1Q8VDC1 1437 aa9.64□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Slc4a3P16283 1227 aa9.64□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Q8BT18 775 aa9.64□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 DaxxO35613 739 aa9.63□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 NclP09405 707 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ankrd26Q811D2 1581 aa9.63□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa9.63□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Gm13697A2AK42 830 aa9.63□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 NeflP08551 543 aa9.63□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Adamts12Q811B3 1600 aa9.62□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Arhgap27A2AB59 869 aa9.62□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 PxdnQ3UQ28 1475 aa9.61□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Arap1Q4LDD4 1452 aa9.61□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 NgefQ8CHT1 710 aa9.61□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 WizO88286 1684 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Aebp1Q640N1 1128 aa9.6□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Gtf2a1Q99PM3 378 aa9.6□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Soga1E1U8D0 1418 aa9.59□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 P3h3Q8CG70 732 aa9.59□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 UacaQ8CGB3 1411 aa9.59□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa9.59□□□□□ -0.87
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Fgd6Q69ZL1 1399 aa9.58□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Erich3F6QRE9 1637 aa9.57□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 DmtnQ9WV69 405 aa9.57□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Abcc2Q8VI47 1543 aa9.57□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa9.57□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 ChgaP26339 463 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Abca16E9PWJ7 1678 aa9.56□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Prdm16A2A935 1275 aa9.56□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa9.56□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 CntlnA2AM05 1397 aa9.56□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Znf692Q3U381 531 aa9.55□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Abca5Q8K448 1642 aa9.55□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 WrnO09053 1401 aa9.54□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa9.53□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 BccipQ9CWI3 316 aa9.53□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 BlmO88700 1416 aa9.53□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Pcf11G3X9Z4 1553 aa9.53□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Shroom2A2ALU4 1481 aa9.53□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ncoa2Q61026 1462 aa9.53□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Naip1Q9QWK5 1403 aa9.53□□□□□ -0.88
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Kcnh8P59111 1102 aa9.52□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 AknaQ80VW7 1404 aa9.51□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Map3k4O08648 1597 aa9.51□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Kif27Q7M6Z4 1394 aa9.5□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Tiam1Q60610 1591 aa9.5□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 AU015836B2RUM3 263 aa9.49□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Jph4Q80WT0 628 aa9.49□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Slx4Q6P1D7 1565 aa9.49□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Neo1P97798 1493 aa9.49□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Lmod2Q3UHZ5 550 aa9.49□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Mrs2Q5NCE8 434 aa9.48□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Pdlim2Q8R1G6 349 aa9.48□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Nkx1-2P42580 305 aa9.47□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Camsap2Q8C1B1 1461 aa9.47□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Zbtb4Q5F293 982 aa9.46□□□□□ -0.89
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa9.46□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 BC005561E9Q5E2 1589 aa9.45□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Gm14025A2AP89 1413 aa9.44□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa9.44□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Abcc1O35379 1528 aa9.44□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Armcx1Q9CX83 456 aa9.44□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ripply1Q2WG77 201 aa9.43□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Znf316Q6PGE4 1016 aa9.43□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Peg3Q3URU2 1571 aa9.43□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 L3mbtl2P59178 703 aa9.43□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Rsph4aQ8BYM7 716 aa9.42□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Chrna2Q91X60 512 aa9.42□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa9.42□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa9.41□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Mink1Q9JM52 1308 aa9.41□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ncoa3O09000 1398 aa9.41□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 CanxP35564 591 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Mre11Q61216 706 aa9.41□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa9.4□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa9.4□□□□□ -0.9
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Gm13695A2AK44 830 aa9.4□□□□□ -0.91
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
Apobec3-209ENSMUST00000176325 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Exoc6Q8R313 802 aa9.39□□□□□ -0.91
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Mug1P28665 1476 aa9.38□□□□□ -0.91
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Fam163aQ8CAA5 168 aa9.38□□□□□ -0.91
Apobec3-209ENSMUST00000176325 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.6 ms