RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173609.1

Gm20387-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20387, Length 1,783 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Setbp1Q9Z180 1582 aa30,71■■■□□ 2,51
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP30,69■■■□□ 2,5
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Camsap2Q8C1B1 1461 aa30,65■■■□□ 2,5
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP30,65■■■□□ 2,5
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP30,64■■■□□ 2,5
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Cabp1Q9JLK7 227 aa30,64■■■□□ 2,5
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Neo1P97798 1493 aa30,64■■■□□ 2,5
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Fgd6Q69ZL1 1399 aa30,63■■■□□ 2,49
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Il16O54824 1322 aa30,63■■■□□ 2,49
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Jph4Q80WT0 628 aa30,61■■■□□ 2,49
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Prex2Q3LAC4 1598 aa30,6■■■□□ 2,49
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Neurod1Q60867 357 aa30,59■■■□□ 2,49
Gm20387-201ENSMUST00000173609 SphkapQ6NSW3 1687 aa30,59■■■□□ 2,49
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa30,59■■■□□ 2,49
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa30,57■■■□□ 2,48
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Mtus2Q3UHD3 1353 aa30,57■■■□□ 2,48
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Naip5Q9R016 1403 aa30,55■■■□□ 2,48
Gm20387-201ENSMUST00000173609 NclP09405 707 aaKnown RBP30,54■■■□□ 2,48
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa30,54■■■□□ 2,48
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Mphosph9A6H5Y1 991 aa30,53■■■□□ 2,48
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Caskin1Q6P9K8 1431 aa30,53■■■□□ 2,48
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP30,52■■■□□ 2,48
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Fancd2Q80V62 1450 aa30,49■■■□□ 2,47
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Ube2uB1AUC4 352 aa30,49■■■□□ 2,47
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP30,48■■■□□ 2,47
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP30,48■■■□□ 2,47
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Kif21bQ9QXL1 1668 aa30,46■■■□□ 2,47
Gm20387-201ENSMUST00000173609 AknaQ80VW7 1404 aa30,45■■■□□ 2,47
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa30,43■■■□□ 2,46
Gm20387-201ENSMUST00000173609 AlkP97793 1621 aa30,42■■■□□ 2,46
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP30,41■■■□□ 2,46
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Gm13697A2AK42 830 aa30,4■■■□□ 2,46
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Gm14025A2AP89 1413 aa30,37■■■□□ 2,45
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa30,35■■■□□ 2,45
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Tdrd9Q14BI7 1383 aa30,35■■■□□ 2,45
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Zfp644E9QA22 1323 aa30,34■■■□□ 2,45
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP30,33■■■□□ 2,45
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Fmn2Q9JL04 1578 aa30,3■■■□□ 2,44
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Chd1P40201 1711 aa30,29■■■□□ 2,44
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Trpm2Q91YD4 1506 aa30,29■■■□□ 2,44
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Rnf17Q99MV7 1640 aa30,28■■■□□ 2,44
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Wdr7Q920I9 1489 aa30,28■■■□□ 2,44
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Abcc1O35379 1528 aa30,28■■■□□ 2,44
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Pkd2O35245 966 aa30,28■■■□□ 2,44
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Pik3c2gO70167 1506 aa30,27■■■□□ 2,44
Gm20387-201ENSMUST00000173609 NhsB1AV60 1647 aa30,27■■■□□ 2,44
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Anks4bQ8K3X6 423 aa30,26■■■□□ 2,43
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa30,24■■■□□ 2,43
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP30,24■■■□□ 2,43
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP30,23■■■□□ 2,43
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Usp47Q8BY87 1376 aa30,21■■■□□ 2,43
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa30,21■■■□□ 2,43
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Pprc1Q6NZN1 1644 aa30,19■■■□□ 2,42
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Mast1Q9R1L5 1570 aa30,19■■■□□ 2,42
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Neurl4Q5NCX5 1563 aa30,18■■■□□ 2,42
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP30,17■■■□□ 2,42
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Cfap74Q3UY96 1578 aa30,16■■■□□ 2,42
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Arhgap5P97393 1501 aa30,13■■■□□ 2,41
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Ttll5Q8CHB8 1328 aa30,11■■■□□ 2,41
Gm20387-201ENSMUST00000173609 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP30,1■■■□□ 2,41
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Abca8bQ8K440 1620 aa30,09■■■□□ 2,41
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP30,08■■■□□ 2,41
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Hecw1Q8K4P8 1604 aa30,07■■■□□ 2,4
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa30,06■■■□□ 2,4
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Abcc3B2RX12 1523 aa30,05■■■□□ 2,4
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Trappc8E9PWG2 1437 aa30,04■■■□□ 2,4
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP30,03■■■□□ 2,4
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP30,02■■■□□ 2,4
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Mbd5B1AYB6 1498 aa29,99■■■□□ 2,39
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Atp10dQ8K2X1 1416 aa29,99■■■□□ 2,39
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Ssh2Q5SW75 1423 aa29,97■■■□□ 2,39
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Igf1rQ60751 1373 aa29,97■■■□□ 2,39
Gm20387-201ENSMUST00000173609 PtprgQ05909 1442 aa29,96■■■□□ 2,39
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP29,96■■■□□ 2,39
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Trak1Q6PD31 939 aa29,95■■■□□ 2,38
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Map4P27546 1125 aaKnown RBP29,93■■■□□ 2,38
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Ncoa1P70365 1447 aa29,92■■■□□ 2,38
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa29,92■■■□□ 2,38
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa29,92■■■□□ 2,38
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP29,91■■■□□ 2,38
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Clstn2Q9ER65 966 aa29,88■■■□□ 2,37
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Asxl1P59598 1514 aa29,87■■■□□ 2,37
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP29,86■■■□□ 2,37
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP29,86■■■□□ 2,37
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Kidins220E9Q9B7 1793 aa29,83■■■□□ 2,37
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Prdm16A2A935 1275 aa29,83■■■□□ 2,37
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Dot1lQ6XZL8 1540 aa29,82■■■□□ 2,36
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Znf608Q56A10 1511 aa29,81■■■□□ 2,36
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Rock1P70335 1354 aa29,79■■■□□ 2,36
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Mug2P28666 1451 aa29,79■■■□□ 2,36
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP29,79■■■□□ 2,36
Gm20387-201ENSMUST00000173609 AI481877A2ALV5 1481 aa29,77■■■□□ 2,36
Gm20387-201ENSMUST00000173609 PtprtQ99M80 1454 aa29,77■■■□□ 2,36
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Rgl3Q3UYI5 709 aa29,75■■■□□ 2,35
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Dapk1Q80YE7 1442 aa29,74■■■□□ 2,35
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP29,74■■■□□ 2,35
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Robo2Q7TPD3 1470 aa29,74■■■□□ 2,35
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP29,74■■■□□ 2,35
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Abca17E9PX95 1733 aa29,74■■■□□ 2,35
Gm20387-201ENSMUST00000173609 Zfyve16Q80U44 1528 aa29,73■■■□□ 2,35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,1 ms