RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111018.1

Srp9-202, Transcript of Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Srp9, Length 823 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9-202ENSMUST00000111018 Eea1Q8BL66 1411 aa42.16■■■■■ 4.34
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
Srp9-202ENSMUST00000111018 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa42.08■■■■■ 4.33
Srp9-202ENSMUST00000111018 Mug1P28665 1476 aa42.08■■■■■ 4.33
Srp9-202ENSMUST00000111018 Pcf11G3X9Z4 1553 aa42.05■■■■■ 4.32
Srp9-202ENSMUST00000111018 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
Srp9-202ENSMUST00000111018 Synj2Q9D2G5 1434 aa42.02■■■■■ 4.32
Srp9-202ENSMUST00000111018 Naip2Q9QUK4 1447 aa42.02■■■■■ 4.32
Srp9-202ENSMUST00000111018 Abca9Q8K449 1623 aa42.02■■■■■ 4.32
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa41.99■■■■■ 4.31
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa41.99■■■■■ 4.31
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kiaa0556Q8C753 1610 aa41.93■■■■■ 4.3
Srp9-202ENSMUST00000111018 Hecw2Q6I6G8 1578 aa41.93■■■■■ 4.3
Srp9-202ENSMUST00000111018 CntlnA2AM05 1397 aa41.9■■■■■ 4.3
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa41.9■■■■■ 4.3
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa41.86■■■■■ 4.29
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cyb5rlB1AS42 316 aa41.76■■■■■ 4.28
Srp9-202ENSMUST00000111018 Brwd3A2AHJ4 1799 aa41.76■■■■■ 4.27
Srp9-202ENSMUST00000111018 Lemd3Q9WU40 921 aa41.74■■■■■ 4.27
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
Srp9-202ENSMUST00000111018 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa41.71■■■■■ 4.27
Srp9-202ENSMUST00000111018 Arhgap5P97393 1501 aa41.71■■■■■ 4.27
Srp9-202ENSMUST00000111018 OvosQ3UU35 1456 aa41.67■■■■■ 4.26
Srp9-202ENSMUST00000111018 Qser1A2BIE1 1698 aa41.67■■■■■ 4.26
Srp9-202ENSMUST00000111018 Lmod2Q3UHZ5 550 aa41.65■■■■■ 4.26
Srp9-202ENSMUST00000111018 Atp10aO54827 1508 aa41.57■■■■■ 4.25
Srp9-202ENSMUST00000111018 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa41.57■■■■■ 4.25
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kidins220E9Q9B7 1793 aa41.55■■■■■ 4.24
Srp9-202ENSMUST00000111018 Yeats2Q3TUF7 1407 aa41.55■■■■■ 4.24
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ptch1Q61115 1434 aa41.54■■■■■ 4.24
Srp9-202ENSMUST00000111018 NexmifQ5DTT1 1515 aa41.54■■■■■ 4.24
Srp9-202ENSMUST00000111018 NpatQ8BMA5 1420 aa41.52■■■■■ 4.24
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kdm5cP41230 1554 aa41.51■■■■■ 4.24
Srp9-202ENSMUST00000111018 Peg3Q3URU2 1571 aa41.5■■■■■ 4.23
Srp9-202ENSMUST00000111018 Naip1Q9QWK5 1403 aa41.49■■■■■ 4.23
Srp9-202ENSMUST00000111018 Trappc8E9PWG2 1437 aa41.48■■■■■ 4.23
Srp9-202ENSMUST00000111018 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.23
Srp9-202ENSMUST00000111018 Abcc3B2RX12 1523 aa41.44■■■■■ 4.23
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dip2cE9PWR4 1557 aa41.44■■■■■ 4.22
Srp9-202ENSMUST00000111018 Neurl4Q5NCX5 1563 aa41.42■■■■■ 4.22
Srp9-202ENSMUST00000111018 Tdrd9Q14BI7 1383 aa41.42■■■■■ 4.22
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa41.41■■■■■ 4.22
Srp9-202ENSMUST00000111018 Tiam1Q60610 1591 aa41.41■■■■■ 4.22
Srp9-202ENSMUST00000111018 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
Srp9-202ENSMUST00000111018 PtprmP28828 1452 aa41.39■■■■■ 4.22
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cfap74Q3UY96 1578 aa41.38■■■■■ 4.22
Srp9-202ENSMUST00000111018 RereQ80TZ9 1558 aa41.38■■■■■ 4.22
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cul9Q80TT8 1865 aa41.37■■■■■ 4.21
Srp9-202ENSMUST00000111018 Camsap2Q8C1B1 1461 aa41.36■■■■■ 4.21
Srp9-202ENSMUST00000111018 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa41.36■■■■■ 4.21
Srp9-202ENSMUST00000111018 Caskin1Q6P9K8 1431 aa41.35■■■■■ 4.21
Srp9-202ENSMUST00000111018 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
Srp9-202ENSMUST00000111018 MyclP10166 368 aa41.27■■■■■ 4.2
Srp9-202ENSMUST00000111018 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
Srp9-202ENSMUST00000111018 Adcy10Q8C0T9 1614 aa41.24■■■■■ 4.19
Srp9-202ENSMUST00000111018 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa41.21■■■■■ 4.19
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ccnb3Q810T2 1396 aa41.16■■■■■ 4.18
Srp9-202ENSMUST00000111018 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa41.14■■■■■ 4.18
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
Srp9-202ENSMUST00000111018 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
Srp9-202ENSMUST00000111018 Hecw1Q8K4P8 1604 aa41.04■■■■■ 4.16
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa41.04■■■■■ 4.16
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa41.04■■■■■ 4.16
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cfap65Q3V0B4 1847 aa41.03■■■■■ 4.16
Srp9-202ENSMUST00000111018 Talpid3E9PV87 1520 aa41.03■■■■■ 4.16
Srp9-202ENSMUST00000111018 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
Srp9-202ENSMUST00000111018 Afap1Q80YS6 731 aa40.93■■■■■ 4.14
Srp9-202ENSMUST00000111018 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa40.93■■■■■ 4.14
Srp9-202ENSMUST00000111018 SphkapQ6NSW3 1687 aa40.93■■■■■ 4.14
Srp9-202ENSMUST00000111018 Nos1Q9Z0J4 1429 aa40.93■■■■■ 4.14
Srp9-202ENSMUST00000111018 Map3k5O35099 1380 aa40.92■■■■■ 4.14
Srp9-202ENSMUST00000111018 Myom2Q14BI5 1463 aa40.9■■■■■ 4.14
Srp9-202ENSMUST00000111018 Abca6Q8K441 1624 aa40.87■■■■■ 4.13
Srp9-202ENSMUST00000111018 Trpm1Q2TV84 1622 aa40.86■■■■■ 4.13
Srp9-202ENSMUST00000111018 Fhod3Q76LL6 1578 aa40.86■■■■■ 4.13
Srp9-202ENSMUST00000111018 Naip6Q9JIB6 1403 aa40.78■■■■■ 4.12
Srp9-202ENSMUST00000111018 Prdm16A2A935 1275 aa40.76■■■■■ 4.12
Srp9-202ENSMUST00000111018 Gli2Q0VGT2 1544 aa40.74■■■■■ 4.11
Srp9-202ENSMUST00000111018 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa40.72■■■■■ 4.11
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
Srp9-202ENSMUST00000111018 Trpm2Q91YD4 1506 aa40.67■■■■■ 4.1
Srp9-202ENSMUST00000111018 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dip2bQ3UH60 1574 aa40.65■■■■■ 4.1
Srp9-202ENSMUST00000111018 Rsph4aQ8BYM7 716 aa40.62■■■■■ 4.09
Srp9-202ENSMUST00000111018 Mast1Q9R1L5 1570 aa40.61■■■■■ 4.09
Srp9-202ENSMUST00000111018 Abcc5Q9R1X5 1436 aa40.6■■■■■ 4.09
Srp9-202ENSMUST00000111018 Fmn2Q9JL04 1578 aa40.57■■■■■ 4.08
Srp9-202ENSMUST00000111018 Mtus2Q3UHD3 1353 aa40.56■■■■■ 4.08
Srp9-202ENSMUST00000111018 Kif3bQ61771 747 aa40.55■■■■■ 4.08
Srp9-202ENSMUST00000111018 Bcl9Q9D219 1425 aa40.55■■■■■ 4.08
Srp9-202ENSMUST00000111018 Dip2aQ8BWT5 1523 aa40.55■■■■■ 4.08
Srp9-202ENSMUST00000111018 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
Srp9-202ENSMUST00000111018 Fbxo41Q6NS60 873 aa40.53■■■■■ 4.08
Srp9-202ENSMUST00000111018 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
Srp9-202ENSMUST00000111018 Knl1Q66JQ7 1612 aa40.51■■■■■ 4.08
Srp9-202ENSMUST00000111018 Topaz1E5FYH1 1653 aa40.5■■■■■ 4.07
Srp9-202ENSMUST00000111018 Uggt2E9Q4X2 1504 aa40.49■■■■■ 4.07
Srp9-202ENSMUST00000111018 RictorQ6QI06 1708 aa40.47■■■■■ 4.07
Srp9-202ENSMUST00000111018 Plekhh2Q8C115 1491 aa40.46■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.7 ms