RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 SphkapQ6NSW3 1687 aa21.62■■□□□ 1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa21.62■■□□□ 1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa21.6■■□□□ 1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plekhh2Q8C115 1491 aa21.59■■□□□ 1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Naip5Q9R016 1403 aa21.59■■□□□ 1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam163aQ8CAA5 168 aa21.58■■□□□ 1.05
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il16O54824 1322 aa21.56■■□□□ 1.04
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prex2Q3LAC4 1598 aa21.55■■□□□ 1.04
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa21.52■■□□□ 1.04
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Chic2Q9D9G3 165 aa21.51■■□□□ 1.03
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Neo1P97798 1493 aa21.51■■□□□ 1.03
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Caskin1Q6P9K8 1431 aa21.49■■□□□ 1.03
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AlkP97793 1621 aa21.49■■□□□ 1.03
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cabp1Q9JLK7 227 aa21.48■■□□□ 1.03
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa21.46■■□□□ 1.03
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fgd6Q69ZL1 1399 aa21.45■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mphosph9A6H5Y1 991 aa21.44■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa21.44■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fancd2Q80V62 1450 aa21.44■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pprc1Q6NZN1 1644 aa21.44■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trpm2Q91YD4 1506 aa21.44■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mtus2Q3UHD3 1353 aa21.43■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm13697A2AK42 830 aa21.42■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Jph4Q80WT0 628 aa21.42■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Anks4bQ8K3X6 423 aa21.4■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa21.4■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fmn2Q9JL04 1578 aa21.39■■□□□ 1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rnf17Q99MV7 1640 aa21.39■■□□□ 1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pik3c2gO70167 1506 aa21.37■■□□□ 1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa21.37■■□□□ 1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Chd1P40201 1711 aa21.37■■□□□ 1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NhsB1AV60 1647 aa21.36■■□□□ 1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdr7Q920I9 1489 aa21.35■■□□□ 1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Neurl4Q5NCX5 1563 aa21.34■■□□□ 1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NclP09405 707 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mast1Q9R1L5 1570 aa21.34■■□□□ 1.01
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp644E9QA22 1323 aa21.32■■□□□ 1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa21.3■■□□□ 1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm14025A2AP89 1413 aa21.29■■□□□ 1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tdrd9Q14BI7 1383 aa21.28■■□□□ 1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AknaQ80VW7 1404 aa21.27■■□□□ 1
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hecw1Q8K4P8 1604 aa21.26■□□□□ 0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp47Q8BY87 1376 aa21.26■□□□□ 0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abcc1O35379 1528 aa21.26■□□□□ 0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cfap74Q3UY96 1578 aa21.25■□□□□ 0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pkd2O35245 966 aa21.24■□□□□ 0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abca8bQ8K440 1620 aa21.24■□□□□ 0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mbd5B1AYB6 1498 aa21.24■□□□□ 0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ube2uB1AUC4 352 aa21.22■□□□□ 0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abcc3B2RX12 1523 aa21.2■□□□□ 0.99
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa21.2■□□□□ 0.98
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ttll5Q8CHB8 1328 aa21.16■□□□□ 0.98
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arhgap5P97393 1501 aa21.16■□□□□ 0.98
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ncoa1P70365 1447 aa21.14■□□□□ 0.97
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa21.13■□□□□ 0.97
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PtprgQ05909 1442 aa21.13■□□□□ 0.97
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Asxl1P59598 1514 aa21.12■□□□□ 0.97
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trappc8E9PWG2 1437 aa21.11■□□□□ 0.97
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ssh2Q5SW75 1423 aa21.1■□□□□ 0.97
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dot1lQ6XZL8 1540 aa21.09■□□□□ 0.97
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kidins220E9Q9B7 1793 aa21.07■□□□□ 0.96
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abca17E9PX95 1733 aa21.05■□□□□ 0.96
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Robo2Q7TPD3 1470 aa21.04■□□□□ 0.96
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp10dQ8K2X1 1416 aa21.04■□□□□ 0.96
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mug2P28666 1451 aa21.03■□□□□ 0.96
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rock1P70335 1354 aa21■□□□□ 0.95
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igf1rQ60751 1373 aa21■□□□□ 0.95
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Naip6Q9JIB6 1403 aa20.99■□□□□ 0.95
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trak1Q6PD31 939 aa20.99■□□□□ 0.95
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Map4P27546 1125 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa20.96■□□□□ 0.95
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa20.96■□□□□ 0.95
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf608Q56A10 1511 aa20.95■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AI481877A2ALV5 1481 aa20.95■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfyve16Q80U44 1528 aa20.94■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa20.93■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ShprhQ7TPQ3 1674 aa20.93■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abca9Q8K449 1623 aa20.93■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myom3A2ABU4 1439 aa20.92■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dapk1Q80YE7 1442 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.7 ms