RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa29.95■■■□□ 2.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abcc5Q9R1X5 1436 aa29.94■■■□□ 2.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mroh2aD3Z750 1679 aa29.94■■■□□ 2.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plekhh2Q8C115 1491 aa29.93■■■□□ 2.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adcy10Q8C0T9 1614 aa29.93■■■□□ 2.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa29.93■■■□□ 2.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Magi1Q6RHR9 1471 aa29.91■■■□□ 2.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Neo1P97798 1493 aa29.9■■■□□ 2.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ube2uB1AUC4 352 aa29.89■■■□□ 2.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cabp1Q9JLK7 227 aa29.89■■■□□ 2.38
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa29.85■■■□□ 2.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Csrnp3P59055 597 aa29.85■■■□□ 2.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mphosph9A6H5Y1 991 aa29.84■■■□□ 2.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam163aQ8CAA5 168 aa29.84■■■□□ 2.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prex2Q3LAC4 1598 aa29.83■■■□□ 2.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SphkapQ6NSW3 1687 aa29.82■■■□□ 2.36
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif21bQ9QXL1 1668 aa29.82■■■□□ 2.36
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Jph4Q80WT0 628 aa29.81■■■□□ 2.36
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fgd6Q69ZL1 1399 aa29.8■■■□□ 2.36
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa29.8■■■□□ 2.36
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtus2Q3UHD3 1353 aa29.79■■■□□ 2.36
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AknaQ80VW7 1404 aa29.78■■■□□ 2.36
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Il16O54824 1322 aa29.75■■■□□ 2.35
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pprc1Q6NZN1 1644 aa29.75■■■□□ 2.35
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa29.68■■■□□ 2.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa29.68■■■□□ 2.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AlkP97793 1621 aa29.66■■■□□ 2.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa29.66■■■□□ 2.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp644E9QA22 1323 aa29.65■■■□□ 2.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fancd2Q80V62 1450 aa29.65■■■□□ 2.34
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp47Q8BY87 1376 aa29.62■■■□□ 2.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Caskin1Q6P9K8 1431 aa29.62■■■□□ 2.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa29.62■■■□□ 2.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pik3c2gO70167 1506 aa29.62■■■□□ 2.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tdrd9Q14BI7 1383 aa29.61■■■□□ 2.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pkd2O35245 966 aa29.6■■■□□ 2.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm14025A2AP89 1413 aa29.59■■■□□ 2.33
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aplp2Q06335 707 aa29.57■■■□□ 2.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stra8P70278 393 aa29.55■■■□□ 2.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnnt3Q9QZ47 272 aa29.54■■■□□ 2.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Chd1P40201 1711 aa29.51■■■□□ 2.31
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abcc1O35379 1528 aa29.49■■■□□ 2.31
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trpm2Q91YD4 1506 aa29.49■■■□□ 2.31
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ncoa1P70365 1447 aa29.46■■■□□ 2.31
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fmn2Q9JL04 1578 aa29.46■■■□□ 2.31
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NhsB1AV60 1647 aa29.41■■■□□ 2.3
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf17Q99MV7 1640 aa29.41■■■□□ 2.3
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa29.4■■■□□ 2.3
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf710Q3U288 666 aa29.39■■■□□ 2.3
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mbd5B1AYB6 1498 aa29.38■■■□□ 2.29
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa29.38■■■□□ 2.29
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arhgap5P97393 1501 aa29.38■■■□□ 2.29
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttll5Q8CHB8 1328 aa29.34■■■□□ 2.29
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr7Q920I9 1489 aa29.33■■■□□ 2.29
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa29.31■■■□□ 2.28
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trappc8E9PWG2 1437 aa29.29■■■□□ 2.28
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cfap74Q3UY96 1578 aa29.27■■■□□ 2.28
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mast1Q9R1L5 1570 aa29.27■■■□□ 2.28
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abca8bQ8K440 1620 aa29.25■■■□□ 2.27
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trak1Q6PD31 939 aa29.23■■■□□ 2.27
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa29.23■■■□□ 2.27
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Neurl4Q5NCX5 1563 aa29.22■■■□□ 2.27
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp10dQ8K2X1 1416 aa29.22■■■□□ 2.27
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mug2P28666 1451 aa29.2■■■□□ 2.26
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map4P27546 1125 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ssh2Q5SW75 1423 aa29.18■■■□□ 2.26
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hecw1Q8K4P8 1604 aa29.18■■■□□ 2.26
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dapk1Q80YE7 1442 aa29.17■■■□□ 2.26
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abcc3B2RX12 1523 aa29.16■■■□□ 2.26
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CenpbP27790 599 aa29.16■■■□□ 2.26
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PtprgQ05909 1442 aa29.15■■■□□ 2.26
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rgl3Q3UYI5 709 aa29.14■■■□□ 2.26
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Naip6Q9JIB6 1403 aa29.14■■■□□ 2.25
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dot1lQ6XZL8 1540 aa29.13■■■□□ 2.25
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa29.12■■■□□ 2.25
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf608Q56A10 1511 aa29.12■■■□□ 2.25
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm13695A2AK44 830 aa29.11■■■□□ 2.25
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igf1rQ60751 1373 aa29.1■■■□□ 2.25
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Asxl1P59598 1514 aa29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.1 ms