RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051454.3

Fam171b-201, Transcript of Protein FAM171B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Fam171b, Length 5,614 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Neurod2Q62414 383 aa22.12■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Shroom4Q1W617 1475 aa22.11■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 UacaQ8CGB3 1411 aa22.11■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rad54l2Q99NG0 1466 aa22.09■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Duox2A2AQ99 1517 aa22.08■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Stard8Q8K031 1019 aa22.08■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa22.08■■□□□ 1.13
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gm6268A2A3U9 297 aa22.08■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Tmf1B9EKI3 1091 aa22.08■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Frmpd1A2AKB4 1549 aa22.07■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ap3b2Q9JME5 1082 aa22.05■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Srcin1Q9QWI6 1250 aa22.04■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Znf316Q6PGE4 1016 aa22.03■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Tdrd9Q14BI7 1383 aa22.03■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rock2P70336 1388 aa22.02■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.02■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 CenpjQ569L8 1344 aa22.01■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Birc3O08863 600 aa22.01■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Znf326O88291 580 aa22■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa21.99■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Fan1Q69ZT1 1020 aa21.99■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ift140E9PY46 1464 aa21.97■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 DaxxO35613 739 aa21.96■■□□□ 1.11
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 CadpsQ80TJ1 1355 aa21.95■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Apbb1Q9QXJ1 710 aa21.94■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 NrkQ9R0G8 1455 aa21.93■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Shq1Q7TMX5 569 aa21.92■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Q8BT18 775 aa21.92■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Dcaf11Q91VU6 549 aa21.92■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Plin1Q8CGN5 517 aa21.91■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Anks4bQ8K3X6 423 aa21.91■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gm14025A2AP89 1413 aa21.9■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Prdm16A2A935 1275 aa21.9■■□□□ 1.1
Fam171b-201ENSMUST00000051454 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cux1P53564 1515 aa21.87■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa21.87■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Grin2bQ01097 1482 aa21.86■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa21.86■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Bcl11bQ99PV8 884 aa21.86■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Plb1Q3TTY0 1478 aa21.85■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nsd2Q8BVE8 1365 aa21.85■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 ErbinQ80TH2 1402 aa21.83■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa21.83■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Wdr62Q3U3T8 1523 aa21.83■■□□□ 1.09
Fam171b-201ENSMUST00000051454 BicraF8VPZ9 1578 aa21.82■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pak3Q61036 559 aa21.81■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa21.81■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pip4k2bQ80XI4 416 aa21.81■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Arhgap5P97393 1501 aa21.8■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Q3TQI7 289 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Trim30dE9PWL0 497 aa21.79■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Slc4a1apE9PX68 744 aa21.77■■□□□ 1.08
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Usp40Q8BWR4 1235 aa21.76■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cabp4Q8VHC5 271 aa21.76■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Usp47Q8BY87 1376 aa21.75■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa21.75■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Golga2Q921M4 999 aa21.73■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa21.73■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Zscan21Q07231 555 aa21.73■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pde4cQ3UEI1 686 aa21.73■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Atf3Q60765 181 aa21.71■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mink1Q9JM52 1308 aa21.71■■□□□ 1.07
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Tnnt1O88346 262 aa21.7■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Map7O88735 730 aa21.7■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Rwdd1Q9CQK7 243 aa21.69■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Crocc2F6XLV1 1638 aa21.69■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Fyb1O35601 819 aa21.68■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Ecm2Q5FW85 670 aa21.67■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Igf1rQ60751 1373 aa21.67■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Map3k5O35099 1380 aa21.67■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Map3k1P53349 1493 aa21.66■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Gm38655A0A286YDK6 273 aa21.66■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Fam163aQ8CAA5 168 aa21.66■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa21.65■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Exoc6Q8R313 802 aa21.64■■□□□ 1.06
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa21.63■■□□□ 1.05
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Clstn1Q9EPL2 979 aa21.63■■□□□ 1.05
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Cyb5rlB1AS42 316 aa21.62■■□□□ 1.05
Fam171b-201ENSMUST00000051454 Stk31Q99MW1 1018 aa21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.6 ms