RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sh3bp5Q9Z131 463 aa19.64■□□□□ 0.73
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa19.63■□□□□ 0.73
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa19.63■□□□□ 0.73
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cabp1Q9JLK7 227 aa19.63■□□□□ 0.73
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fmn1Q05860 1466 aa19.62■□□□□ 0.73
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Baz1bQ9Z277 1479 aa19.62■□□□□ 0.73
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Birc3O08863 600 aa19.61■□□□□ 0.73
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Txndc2Q6P902 515 aa19.59■□□□□ 0.73
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mphosph9A6H5Y1 991 aa19.59■□□□□ 0.73
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Exoc6Q8R313 802 aa19.58■□□□□ 0.72
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfp777B9EKF4 885 aa19.53■□□□□ 0.72
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Arhgap35Q91YM2 1499 aa19.53■□□□□ 0.72
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rock2P70336 1388 aa19.49■□□□□ 0.71
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Golga2Q921M4 999 aa19.45■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pibf1E9Q6K3 756 aa19.44■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc27Q3V036 639 aa19.44■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Supt16hQ920B9 1047 aa19.44■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CrbnQ8C7D2 445 aa19.43■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CntlnA2AM05 1397 aa19.4■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Anapc15P60007 132 aa19.4■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pcmtd1P59913 357 aa19.4■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ubap1lG3UW59 384 aa19.4■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Plekhh2Q8C115 1491 aa19.4■□□□□ 0.7
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sycp2Q9CUU3 1500 aa19.4■□□□□ 0.7
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Srcin1Q9QWI6 1250 aa19.36■□□□□ 0.69
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa19.34■□□□□ 0.69
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa19.32■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ksr2Q3UVC0 959 aa19.32■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Synj1Q8CHC4 1574 aa19.32■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccnb3Q810T2 1396 aa19.31■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Erich6bQ9D4S6 220 aa19.3■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Chmp3Q9CQ10 224 aa19.29■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 EspnQ9ET47 871 aa19.29■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MecomP14404 1042 aa19.28■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CftrP26361 1476 aa19.28■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Iffo2Q8R2V2 512 aa19.27■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CgnP59242 1191 aa19.27■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 GorabQ8BRM2 368 aa19.27■□□□□ 0.68
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CenpjQ569L8 1344 aa19.26■□□□□ 0.67
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Brpf1B2RRD7 1212 aa19.25■□□□□ 0.67
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ap3b2Q9JME5 1082 aa19.24■□□□□ 0.67
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 HdgfP51859 237 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Carmil1Q6EDY6 1374 aa19.24■□□□□ 0.67
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pank3Q8R2W9 370 aa19.22■□□□□ 0.67
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dnai1Q8C0M8 701 aa19.21■□□□□ 0.67
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tsen2Q6P7W5 460 aa19.2■□□□□ 0.66
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Shq1Q7TMX5 569 aa19.19■□□□□ 0.66
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cabp4Q8VHC5 271 aa19.18■□□□□ 0.66
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Usp47Q8BY87 1376 aa19.18■□□□□ 0.66
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa19.17■□□□□ 0.66
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ipo8Q7TMY7 1010 aa19.17■□□□□ 0.66
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mink1Q9JM52 1308 aa19.15■□□□□ 0.66
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Usp40Q8BWR4 1235 aa19.15■□□□□ 0.66
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mical1Q8VDP3 1048 aa19.15■□□□□ 0.66
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Adam1bQ8R534 806 aa19.15■□□□□ 0.66
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