RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prex2Q3LAC4 1598 aa28.61■■■□□ 2.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fhod3Q76LL6 1578 aa28.6■■■□□ 2.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Jph4Q80WT0 628 aa28.58■■■□□ 2.17
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa28.58■■■□□ 2.17
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa28.44■■■□□ 2.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fancd2Q80V62 1450 aa28.43■■■□□ 2.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mphosph9A6H5Y1 991 aa28.42■■■□□ 2.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Il16O54824 1322 aa28.42■■■□□ 2.14
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp644E9QA22 1323 aa28.39■■■□□ 2.14
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa28.39■■■□□ 2.14
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tdrd9Q14BI7 1383 aa28.38■■■□□ 2.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Caskin1Q6P9K8 1431 aa28.35■■■□□ 2.13
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Naip5Q9R016 1403 aa28.34■■■□□ 2.13
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chd1P40201 1711 aa28.29■■■□□ 2.12
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Camsap2Q8C1B1 1461 aa28.25■■■□□ 2.11
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif21bQ9QXL1 1668 aa28.19■■■□□ 2.1
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa28.15■■■□□ 2.1
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp10dQ8K2X1 1416 aa28.04■■■□□ 2.08
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Clstn2Q9ER65 966 aa27.77■■■□□ 2.04
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dot1lQ6XZL8 1540 aa27.74■■■□□ 2.03
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Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfyve16Q80U44 1528 aa27.73■■■□□ 2.03
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