RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	TIP20	P33891	701 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YSW1	P38280	609 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	KTR7	P40504	517 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	COG1	P53079	417 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RTS3	P53289	263 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YPR109W	Q06104	294 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SFG1	Q12507	346 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	LDB16	P25587	256 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SEC61	P32915	480 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	NUP120	P35729	1037 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YRO2	P38079	344 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	STE24	P47154	453 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	TAD1	P53065	400 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YGR066C	P53242	292 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	ATP25	Q03153	612 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RSM10	Q03201	203 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	ROT1	Q03691	256 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	COS7	Q07788	383 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	UBR2	Q07963	1872 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.07	□□□□□ -1.92	not detected
STE6	YKL209C	SEC62	P21825	274 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YCR102C	P25608	368 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MRPL9	P31334	269 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	END3	P39013	349 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RGA1	P39083	1007 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YEL073C	P39974	107 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	JEM1	P40358	645 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	ECM9	Q02202	377 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	GUP2	Q08929	609 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SRO7	Q12038	1033 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	FRT1	Q99332	602 aa		3.07	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MIA40	P36046	403 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YHR112C	P38716	378 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MRK1	P50873	501 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	PEX25	Q02969	394 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	ECI1	Q05871	280 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	NUT2	Q06213	157 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YDL218W	Q07629	317 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MED2	Q12124	431 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MDY2	Q12285	212 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	LAA1	P39526	2014 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RAD1	P06777	1100 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	COS2	P0CX12	379 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	COS3	P0CX13	379 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	NPR1	P22211	790 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	NFU1	P32860	256 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	LRO1	P40345	661 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	COS4	P43542	379 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	NIT2	P47016	307 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YJR149W	P47177	404 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YDR131C	Q03899	556 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YLR446W	Q06204	433 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	IRC13	Q08630	104 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	AKR2	Q12013	749 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	GET4	Q12125	312 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	STE7	P06784	515 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	PLB1	P39105	664 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YDR541C	Q03049	344 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	VPS16	Q03308	798 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MIX14	Q04341	121 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MLH3	Q12083	715 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	UPC2	Q12151	913 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.06	□□□□□ -1.92	not detected
STE6	YKL209C	YLR111W	Q12528	110 aa		3.06	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	ERG11	P10614	530 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	CLN2	P20438	545 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	VPS34	P22543	875 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	CDC5	P32562	705 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	CBP4	P37267	147 aa		3.05	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
STE6	YKL209C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.05	□□□□□ -1.92	not detected

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