RNA–Protein interactions for RNA: YBR103W

SIF2, Transcript of WD40 repeat-containing subunit of Set3C histone deacetylase complex, yeast

Gene SIF2, Length 1,608 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIF2	YBR103W	COG2	P53271	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	CAF120	P53836	1060 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	SLG1	P54867	378 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	NSE5	Q03718	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	RNH1	Q04740	348 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	HUA2	Q12134	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	NSI1	Q12457	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	MSS18	P08593	268 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	MAS1	P10507	462 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	GPA2	P10823	449 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	PEX2	P32800	271 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	TKL2	P33315	681 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	CSG2	P35206	410 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	QRI7	P43122	407 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	MDE1	P47095	244 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	VPS25	P47142	202 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	MIG2	P53035	382 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YGL108C	P53139	140 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	TNA1	P53322	534 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	BSC5	P53755	489 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	GPI17	Q04080	534 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	URH1	Q04179	340 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	GPM2	Q12008	311 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	YOS9	Q99220	542 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	ECM3	Q99252	613 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SIF2	YBR103W	DIF1	O13577	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ATP6	P00854	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ATP12	P22135	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	FRE1	P32791	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	CYM1	P32898	989 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RPC25	P35718	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YHR112C	P38716	378 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MSS4	P38994	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	VMA7	P39111	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SSO2	P39926	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YJL070C	P40361	888 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YIL077C	P40508	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SHR5	P41912	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	FMP32	P43557	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	GLG2	P47011	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	NPY1	P53164	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SPO77	Q06134	477 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YPD1	Q07688	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	AIM41	Q12032	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RRD2	Q12461	358 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YPT6	Q99260	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BI4	P03879	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ATR1	P13090	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MIH1	P23748	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	FUN30	P31380	1131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	MCM10	P32354	571 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	YKL050C	P35736	922 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	HES1	P35843	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	ETR1	P38071	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	POP7	P38291	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TDP1	P38319	544 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TRM5	P38793	499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	CEM1	P39525	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	TMA108	P40462	946 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	IRC5	P43610	853 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	NMD5	P46970	1048 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	BNA2	P47125	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	HXT16	P47185	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	PUS2	P53167	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	GOR1	P53839	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SIF2	YBR103W	VAC7	P53950	1165 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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