RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	RPP1	P38786	293 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	REV7	P38927	245 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	YJL193W	P39542	402 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	TMN3	P40071	706 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	SLM1	P40485	686 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	MAF1	P41910	395 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	EPL1	P43572	832 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	AQR1	P53943	586 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	SHR3	Q02774	210 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	YMR102C	Q03177	834 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	MMT1	Q03218	510 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	WAR1	Q03631	944 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	TPO1	Q07824	586 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	MED7	Q08278	222 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	YOR352W	Q08816	343 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	AHC1	Q12433	566 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	CYC7	P00045	113 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	SUC2	P00724	532 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	CLC1	P17891	233 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	YBR144C	P34215	104 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	RPC25	P35718	212 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	PHO11	P35842	467 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	TAE1	P38340	232 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	PHO12	P38693	467 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	AVT1	P47082	602 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	GTO1	P48239	356 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	PMT5	P52867	743 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	YGR079W	P53249	370 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	CRT10	Q08226	957 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	DCI1	Q08558	271 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	PUS9	Q12069	462 aa		2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
AI2	Q0055	GAL3	P13045	520 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	MAK32	P23060	363 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	GRR1	P24814	1151 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	DAL2	P25335	343 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	PEP3	P27801	918 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	HIR2	P32480	875 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	FRE1	P32791	686 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YJL070C	P40361	888 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	OTU1	P43558	301 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	TOS3	P43637	560 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	COS1	P53822	381 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YAT1	P80235	687 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	RSM28	Q03430	361 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	HRD3	Q05787	833 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YOR365C	Q08844	703 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	GAL10	P04397	699 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	HIS5	P07172	385 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	ALG1	P16661	449 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	CLN1	P20437	546 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	DAL81	P21657	970 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	KIN82	P25341	720 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	GSH1	P32477	678 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.77	□□□□□ -1.97	not detected
AI2	Q0055	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	RPC34	P32910	317 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	CAB3	P36076	571 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YKR075C	P36155	307 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	LEU5	P38702	357 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	FAD1	P38913	306 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	UIP3	P39547	235 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	TAX4	P47030	604 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YGR149W	P48236	432 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	CTR1	P49573	406 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	SKO1	Q02100	647 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	SMA1	Q02651	245 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	RSN1	Q03516	953 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	PPM1	Q04081	328 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	CRN1	Q06440	651 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	ARR1	Q06596	294 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	YLR413W	Q06689	675 aa		2.77	□□□□□ -1.97
AI2	Q0055	BAG7	Q12128	409 aa		2.77	□□□□□ -1.97

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