RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 TEX11Q8IYF3 940 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 IL1R1P14778 569 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 ASIC1P78348 528 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CTAGE8P0CG41 777 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 C8orf37Q96NL8 207 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 MMS19Q96T76 1030 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 SEMA3FQ13275 785 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 STIM1Q13586 685 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CNBD1Q8NA66 436 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 MYMKA6NI61 221 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 UFL1O94874 794 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 GLIS3Q8NEA6 775 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 GAKO14976 1311 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.93□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 TDP2O95551 362 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PDHBP11177 359 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CRY2Q49AN0 593 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 C6orf50Q9HD87 102 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 SLC39A2Q9NP94 309 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 KCNK18Q7Z418 384 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 POLLQ9UGP5 575 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 POTEB2H3BUK9 544 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CYP27A1Q02318 531 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 MCM6Q14566 821 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 COA7Q96BR5 231 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 SIK3Q9Y2K2 1263 aa14.92□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 ESYT2A0FGR8 921 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 POTEMA6NI47 508 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 LDHCP07864 332 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 RFC4P35249 363 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 TXKP42681 527 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PIP4K2BP78356 416 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 ZBED6P86452 979 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 ECM1Q16610 540 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CENPPQ6IPU0 288 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 JAKMIP2Q96AA8 810 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 GNA11P29992 359 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 BICDL2A1A5D9 508 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF185O15231 689 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 SMARCA1P28370 1054 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 WDR93Q6P2C0 686 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CERKQ8TCT0 537 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PQJ5 194 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 GABPAQ06546 454 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 EHHADHQ08426 723 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 CASP8Q14790 479 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 HDXQ7Z353 690 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 GJA10Q969M2 543 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 SNHG28P0DPA3 235 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 USP14P54578 494 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 FIGNQ5HY92 759 aa14.9□□□□□ -0.02
C9orf170-201ENST00000623052 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms