RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621218.4

PLP1-223, Transcript of proteolipid protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLP1, Length 3,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLP1-223	ENST00000621218	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	BUB1	O43683	1085 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	BMP15	O95972	392 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	KIF11	P52732	1056 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CDK17	Q00537	523 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	E2F5	Q15329	346 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CD302	Q8IX05	232 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC114	Q96M63	670 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	TNKS	O95271	1327 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	XBP1	P17861	261 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ITGA6	P23229	1130 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	PPP2R5A	Q15172	486 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	IFT20	Q8IY31	132 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	TMTC2	Q8N394	836 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	NUP58	Q9BVL2	599 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	GGA2	Q9UJY4	613 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PLP1-223	ENST00000621218	TMOD1	P28289	359 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	STAT6	P42226	847 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PAFAH1B1	P43034	410 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	DNA2	P51530	1060 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SNCB	Q16143	134 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CHADL	Q6NUI6	762 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TMC4	Q7Z404	712 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MREG	Q8N565	214 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PLAA	Q9Y263	795 aa		10.21	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SCLT1	Q96NL6	688 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	DISC1	Q9NRI5	854 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RTN2	O75298	545 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PDE8B	O95263	885 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	LCA5L	O95447	670 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CDR1	P51861	262 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RCAN1	P53805	252 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SATB1	Q01826	763 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	LPIN2	Q92539	896 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218		A0A1W2PQJ5	194 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PSMA7	O14818	248 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RHOBTB3	O94955	611 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RASSF7	Q02833	373 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PAK2	Q13177	524 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SGSM3	Q96HU1	749 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	KRT12	Q99456	494 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		10.2	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	GMNC	A6NCL1	334 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218		H0YGN5	161 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TRAPPC3	O43617	180 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TROAP	Q12815	778 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	STK4	Q13043	487 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	DRP2	Q13474	957 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	RASGRF1	Q13972	1273 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	KCNB1	Q14721	858 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	TEX11	Q8IYF3	940 aa		10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
PLP1-223	ENST00000621218	SPATA5	Q8NB90	893 aa		10.19	□□□□□ -0.78

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