RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615579.1

TTC28-AS1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_3, Length 181 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM47Q96LD4 638 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PSTPIP2Q9H939 334 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 C6orf50Q9HD87 102 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TMEM260Q9NX78 707 aa16.71■□□□□ 0.27
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADAMTS3O15072 1205 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ADORA2AP29274 412 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CAP1Q01518 475 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KRT40Q6A162 431 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MCF2L2Q86YR7 1114 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ERO1AQ96HE7 468 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DOCK3Q8IZD9 2030 aa16.7■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POLR2MP0CAP2 368 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PTPREP23469 700 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LBX1P52954 281 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RPS6P62753 249 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 UBXN2AP68543 259 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CNTN2Q02246 1040 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MCTP1Q6DN14 999 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PHF20Q9BVI0 1012 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SH3GLB2Q9NR46 395 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PFASO15067 1338 aa16.69■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 POTEB2H3BUK9 544 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DPP9Q86TI2 863 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 OXER1Q8TDS5 423 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BRMS1Q9HCU9 246 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COL20A1Q9P218 1284 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHA4Q9UN74 947 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GABRQQ9UN88 632 aa16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 LRRC37A2A6NM11 1700 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MMP1P03956 469 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CYP2B6P20813 491 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GNA11P29992 359 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KRT2P35908 639 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PRKCZQ05513 592 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GRB14Q14449 540 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BLIDQ8IZY5 108 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BICD2Q8TD16 824 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NUDT12Q9BQG2 462 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TRIM17Q9Y577 477 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MCM3APO60318 1980 aa16.67■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ESYT2A0FGR8 921 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SLC15A5A6NIM6 579 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SPDYE3A6NKU9 549 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MEIS2O14770 477 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 HSD17B4P51659 736 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NR5A1Q13285 461 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SOCS4Q8WXH5 440 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 TAAR1Q96RJ0 339 aa16.66■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYH7BA7E2Y1 1941 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 COBLO75128 1261 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PDCP20941 246 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SYT1P21579 422 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MAP2K5Q13163 448 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NPY5RQ15761 445 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ARHGEF16Q5VV41 709 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FERMT3Q86UX7 667 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 NPLOC4Q8TAT6 608 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ANO3Q9BYT9 981 aa16.65■□□□□ 0.26
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 SOWAHBA6NEL2 793 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FAM205CA6NFA0 338 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 BTBD18B2RXH4 712 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STRNO43815 780 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RGS2P41220 211 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 FLT3LGP49771 235 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MORN1Q5T089 497 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 RMDN3Q96TC7 470 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 APBA2Q99767 749 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 GLT8D2Q9H1C3 349 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 ASTN1O14525 1302 aa16.64■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 KIF28PB7ZC32 967 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 STX6O43752 255 aa16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms