RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 AOC2O75106 756 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-212ENST00000597259 B3GALT4O96024 378 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-212ENST00000597259 NEFLP07196 543 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-212ENST00000597259 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC3-212ENST00000597259 NPR1P16066 1061 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-212ENST00000597259 ST5P78524 1137 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-212ENST00000597259 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
HERC3-212ENST00000597259 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HERC3-212ENST00000597259 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.98□□□□□ -1.29
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HERC3-212ENST00000597259 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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HERC3-212ENST00000597259 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-212ENST00000597259 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.98□□□□□ -1.29
HERC3-212ENST00000597259 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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HERC3-212ENST00000597259 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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HERC3-212ENST00000597259 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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HERC3-212ENST00000597259 HOMEZQ8IX15 550 aa6.96□□□□□ -1.3
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HERC3-212ENST00000597259 ABCB6Q9NP58 842 aa6.96□□□□□ -1.3
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HERC3-212ENST00000597259 LIG1P18858 919 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-212ENST00000597259 FUT4P22083 530 aa6.94□□□□□ -1.3
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HERC3-212ENST00000597259 TSPYL6Q8N831 410 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-212ENST00000597259 JMYQ8N9B5 988 aa6.94□□□□□ -1.3
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HERC3-212ENST00000597259 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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HERC3-212ENST00000597259 MISP3Q96FF7 219 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-212ENST00000597259 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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HERC3-212ENST00000597259 IFT57Q9NWB7 429 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-212ENST00000597259 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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