RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596951.5

FCHO1-218, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-218ENST00000596951 TMEM60Q9H2L4 133 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 CACNA1SQ13698 1873 aa12.88□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 ERCC3P19447 782 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 MMP14P50281 582 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 GNGT1P63211 74 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 CCDC122Q5T0U0 273 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 JAKMIP2Q96AA8 810 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 IL17RBQ9NRM6 502 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 SAMM50Q9Y512 469 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 DUOX1Q9NRD9 1551 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 TTC26A0AVF1 554 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 PMS1P54277 932 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 C2orf54Q08AI8 447 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 TRIM14Q14142 442 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 INF2Q27J81 1249 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 FBXO33Q7Z6M2 555 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 CXorf56Q9H5V9 222 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 ARAP2Q8WZ64 1704 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 KCNJ18B7U540 433 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 PSEN1P49768 467 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 KCNJ12Q14500 433 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 TCP11X2Q5H9J9 407 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 LRRC15Q8TF66 581 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 UIMC1Q96RL1 719 aa12.87□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 RCCD1A6NED2 376 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 RGL2O15211 777 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 INPP5BP32019 993 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 UBXN1Q04323 297 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 WDR59Q6PJI9 974 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 CAGE1Q8TC20 777 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 NELFBQ8WX92 580 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 VAT1LQ9HCJ6 419 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 SLC15A2Q16348 729 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 PDXDC2PQ6P474 469 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 PNMA1Q8ND90 353 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 SH3GL2Q99962 352 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 LACRTQ9GZZ8 138 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 FAM184BQ9ULE4 1060 aa12.86□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 SHTN1A0MZ66 631 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 PRCPP42785 496 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 CNPY4Q8N129 248 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 OR8K1Q8NGG5 319 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 HDAC7Q8WUI4 952 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 HPS3Q969F9 1004 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 FERMT2Q96AC1 680 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 RWDD2AQ9UIY3 292 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 CYTH3O43739 400 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 DDAH1O94760 285 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 NLGN1Q8N2Q7 840 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 MKNK2Q9HBH9 465 aa12.85□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 MAP2K2P36507 400 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 STAT6P42226 847 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 SPAG1Q07617 926 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 PAK1Q13153 545 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 POTEDQ86YR6 584 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 ARL8AQ96BM9 186 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 DUSP10Q9Y6W6 482 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 GRAPQ13588 217 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 KIAA1328Q86T90 577 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 BLIDQ8IZY5 108 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 DNAJC7Q99615 494 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 CAPN7Q9Y6W3 813 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 RPN1P04843 607 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 RCAN1P53805 252 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 TTMPQ5BVD1 217 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 GBP6Q6ZN66 633 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 IRF2BP1Q8IU81 584 aa12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
FCHO1-218ENST00000596951 GOLGA8KD6RF30 607 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-218ENST00000596951 MYO1FO00160 1098 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-218ENST00000596951 CALM1P0DP23 149 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-218ENST00000596951 CALM2P0DP24 149 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-218ENST00000596951 CALM3P0DP25 149 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-218ENST00000596951 FNTAP49354 379 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-218ENST00000596951 KLK7P49862 253 aa12.83□□□□□ -0.36
FCHO1-218ENST00000596951 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms