RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 MYH8P13535 1937 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 NHSQ6T4R5 1651 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 PLCG1P19174 1290 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 USP8P40818 1118 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 ASIC1P78348 528 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 BRD3Q15059 726 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 HDXQ7Z353 690 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 ADSSL1Q8N142 457 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 OR8K1Q8NGG5 319 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 SETDB2Q96T68 719 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 UBA5Q9GZZ9 404 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 RMND1Q9NWS8 449 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 DUOX1Q9NRD9 1551 aa11.92□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 RCCD1A6NED2 376 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 SEMA3EO15041 775 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 APBA3O96018 575 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 FGRP09769 529 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 CALML3P27482 149 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 LONP1P36776 959 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 SPAG1Q07617 926 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 PDE4DQ08499 809 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 STK4Q13043 487 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 TXNRD1Q16881 649 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 KRT26Q7Z3Y9 468 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 NAPAP54920 295 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 EIF6P56537 245 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 WDR59Q6PJI9 974 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 GIMAP7Q8NHV1 300 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 MMS19Q96T76 1030 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 SLC39A2Q9NP94 309 aa11.91□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 PSMA7O14818 248 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 TRAPPC10P48553 1259 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 HERVK_113P62684 666 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 NFIXQ14938 502 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 GBP6Q6ZN66 633 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 DYMQ7RTS9 669 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC51Q96ER9 411 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 DOCK2Q92608 1830 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 PCNTO95613 3336 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 KLRF2D3W0D1 207 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 H7C1D1 291 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 ZPR1O75312 459 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 GJA10Q969M2 543 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM47Q9BQJ4 181 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM260Q9NX78 707 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-216ENST00000596536 LGALS16A8MUM7 142 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 BTAF1O14981 1849 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 KLRC4O43908 158 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 TXKP42681 527 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 DNA2P51530 1060 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 SCN7AQ01118 1682 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 CASP8Q14790 479 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 C12orf60Q5U649 245 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 DEFB132Q7Z7B7 95 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 CABP7Q86V35 215 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 CLEC10AQ8IUN9 316 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 CAGE1Q8TC20 777 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 FAM107BQ9H098 131 aa11.9□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 CACNA1SQ13698 1873 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 RFC4P35249 363 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 STIM1Q13586 685 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 HSP90B2PQ58FF3 399 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 JADE2Q9NQC1 790 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 ERLIN1O75477 346 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 FAM204AQ9H8W3 233 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 EXOC1Q9NV70 894 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 L1RE1Q9UN81 338 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 SMCO2A6NFE2 343 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-216ENST00000596536 STXBP3O00186 592 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.3 ms