RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 EDNRBP24530 442 aa23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 SMARCA1P28370 1054 aa23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 KIF5BP33176 963 aa23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 RNF180Q86T96 592 aa23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 HOMER1Q86YM7 354 aa23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 KLHDC9Q8NEP7 349 aa23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 VTA1Q9NP79 307 aa23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 PHF24Q9UPV7 400 aa23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 CALM1P0DP23 149 aa23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 CALM2P0DP24 149 aa23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 CALM3P0DP25 149 aa23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 ADCYAP1R1P41586 468 aa23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 NKX3-2P78367 333 aa23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 COL20A1Q9P218 1284 aa23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.09■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 RXRAP19793 462 aa23.08■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 CST5P28325 142 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 HSD17B4P51659 736 aa23.08■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 GJA9P57773 515 aa23.08■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 TNFAIP2Q03169 654 aa23.08■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.08■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.08■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
EFTUD2-217ENST00000590124 MYADML2A6NDP7 307 aa23.07■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 CTAGE5O15320 804 aa23.07■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.07■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 SMPD1P17405 629 aa23.07■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 GNAQP50148 359 aa23.07■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 TRAF1Q13077 416 aa23.07■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 SNX17Q15036 470 aa23.07■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.07■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.07■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.07■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 APOA5Q6Q788 366 aa23.06■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.06■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 FANCBQ8NB91 859 aa23.06■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 FERMT2Q96AC1 680 aa23.06■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.06■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 CFBP00751 764 aa23.05■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 CPA1P15085 419 aa23.05■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 ACLYP53396 1101 aa23.05■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 PDE4DQ08499 809 aa23.05■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.05■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.05■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.05■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 USP26Q9BXU7 913 aa23.05■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A1W2PQY0 241 aa23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 MOXD2PA6NHM9 499 aa23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 B4DLN1 442 aa23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 PTGS1P23219 599 aa23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 RTP1P59025 263 aa23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 KCNA10Q16322 511 aa23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 MICU3Q86XE3 530 aa23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 SPC25Q9HBM1 224 aa23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 Q9Y3F1 56 aa23.04■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.03■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.03■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 TLK2Q86UE8 772 aa23.03■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 IWS1Q96ST2 819 aa23.03■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 RMDN3Q96TC7 470 aa23.03■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 PRO3102Q9H379 93 aa23.03■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 CEP290O15078 2479 aa23.03■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.02■■□□□ 1.28
EFTUD2-217ENST00000590124 GNASQ5JWF2 1037 aa23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms