RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.34□□□□□ -0.91
GGA3-218ENST00000584243 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
GGA3-218ENST00000584243 SIL1Q9H173 461 aa9.34□□□□□ -0.91
GGA3-218ENST00000584243 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.34□□□□□ -0.91
GGA3-218ENST00000584243 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.34□□□□□ -0.91
GGA3-218ENST00000584243 STARD7Q9NQZ5 370 aa9.34□□□□□ -0.91
GGA3-218ENST00000584243 FAM50BQ9Y247 325 aa9.34□□□□□ -0.91
GGA3-218ENST00000584243 A0A0D9SFI3 127 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 H3BQV1 296 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 TAF4O00268 1085 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 MBTPS2O43462 519 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 CNMDO75829 334 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 PTPREP23469 700 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 ACLYP53396 1101 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 CTSWP56202 376 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 EVCP57679 992 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 TCP10Q12799 353 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 GRB14Q14449 540 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 GORABQ5T7V8 394 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 FAM227BQ96M60 508 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 ANKRD2Q9GZV1 360 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa9.33□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 STXBP3O00186 592 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 PFKFB2O60825 505 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 ADAMTS4O75173 837 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 CD4P01730 458 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 CSF1RP07333 972 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 CCL23P55773 120 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 CHRNDQ07001 517 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 SPP2Q13103 211 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 CLUL1Q15846 466 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 ME3Q16798 604 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 IL25Q9H293 177 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 CHMP3Q9Y3E7 222 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 PTPRSQ13332 1948 aa9.32□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 PROS1P07225 676 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 RCAN1P53805 252 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 MAP3K10Q02779 954 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 RING1Q06587 406 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 TRDNQ13061 729 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 BRAPQ7Z569 592 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 APPBP2Q92624 585 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 SPATA32Q96LK8 384 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 MAP7D2Q96T17 732 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 RBSNQ9H1K0 784 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 TMOD2Q9NZR1 351 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 MYO7AQ13402 2215 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GUL7 405 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 FIBPO43427 364 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 OFD1O75665 1012 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 GNAT2P19087 354 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 UBE3CQ15386 1083 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
GGA3-218ENST00000584243 RNF180Q86T96 592 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms