RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582453.5

MSI2-215, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-215	ENST00000582453	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-215	ENST00000582453	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-215	ENST00000582453	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-215	ENST00000582453	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-215	ENST00000582453	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-215	ENST00000582453	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-215	ENST00000582453	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-215	ENST00000582453	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MSI2-215	ENST00000582453	SYNJ2	O15056	1496 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453		A0A1W2PQ27	194 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453		A0A1W2PQ64	194 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453		A0A1W2PQC6	194 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453		A0A1W2PQD8	194 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	OR14I1	A6ND48	311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	HRK	O00198	91 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	PEX10	O60683	326 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	HOXC12	P31275	282 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	RBL2	Q08999	1139 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SCRN1	Q12765	414 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	TBX1	O43435	398 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	CP	P00450	1065 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	MPO	P05164	745 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SCG5	P05408	212 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	MVK	Q03426	396 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	MMP19	Q99542	508 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	LGR4	Q9BXB1	951 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	ABLIM1	O14639	778 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	CAPNS1	P04632	268 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	THBD	P07204	575 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	C8A	P07357	584 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	PLS3	P13797	630 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	PKN1	Q16512	942 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	ADAMTS12	P58397	1594 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	NUP160	Q12769	1436 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453		A0A1W2PQU0	124 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	PDPK1	O15530	556 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	NPHS1	O60500	1241 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SEMA7A	O75326	666 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	TSPAN15	O95858	294 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	GFRA1	P56159	465 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SERINC3	Q13530	473 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	NR1I3	Q14994	352 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	TESK1	Q15569	626 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	GRIN2A	Q12879	1464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	PRX	Q9BXM0	1461 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	C7orf72	A4D263	438 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	NFIB	O00712	420 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	CYBB	P04839	570 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MSI2-215	ENST00000582453	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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