RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572083.5

CCDC40-206, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC40, Length 816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-206ENST00000572083 MTMR7Q9Y216 660 aa23.56■■□□□ 1.36
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CCDC40-206ENST00000572083 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 FAM122AQ96E09 287 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 NAPBQ9H115 298 aa23.55■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 NMT2O60551 498 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 PFKMP08237 780 aa23.54■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.54■■□□□ 1.36
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CCDC40-206ENST00000572083 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.53■■□□□ 1.36
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CCDC40-206ENST00000572083 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa23.53■■□□□ 1.36
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CCDC40-206ENST00000572083 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 ERC2O15083 957 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.52■■□□□ 1.36
CCDC40-206ENST00000572083 TSPY2A6NKD2 308 aa23.51■■□□□ 1.35
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CCDC40-206ENST00000572083 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
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CCDC40-206ENST00000572083 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 INCENPQ9NQS7 918 aa23.51■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 NFIBO00712 420 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 ARHGEF15O94989 841 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 ACTN1P12814 892 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 CPT1AP50416 773 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.5■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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CCDC40-206ENST00000572083 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
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CCDC40-206ENST00000572083 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 SLC9A7Q96T83 725 aa23.49■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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CCDC40-206ENST00000572083 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.47■■□□□ 1.35
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CCDC40-206ENST00000572083 CALML3P27482 149 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 RFC2P35250 354 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 DCAF4Q8WV16 495 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 DCTPP1Q9H773 170 aa23.46■■□□□ 1.35
CCDC40-206ENST00000572083 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 PITPNM1O00562 1244 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 PPP2R5BQ15173 497 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 RETREG2Q8NC44 543 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 COPS5Q92905 334 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 COG5Q9UP83 839 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 PTPRSQ13332 1948 aa23.45■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 RAD50Q92878 1312 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 CHMP4BP1P59074 171 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 PDE4DQ08499 809 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 NFRKBQ6P4R8 1299 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 LRFN3Q9BTN0 628 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.44■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 KIF28PB7ZC32 967 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 TLL1O43897 1013 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 GRB10Q13322 594 aa23.43■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CCDC40-206ENST00000572083 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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