RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568227.5

SNAP23-215, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 4

Gene SNAP23, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	AMPD2	Q01433	879 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	SHD	Q96IW2	340 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	GLI4	P10075	376 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	NCAM1	P13591	858 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	PAM	P19021	973 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	PRR5	P85299	388 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	PEX11G	Q96HA9	241 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	NCAPH	Q15003	741 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	STXBP3	O00186	592 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	SUV39H1	O43463	412 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	NPHS1	O60500	1241 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	VAMP4	O75379	141 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	TACR1	P25103	407 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	FOXO4	P98177	505 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	ALG3	Q92685	438 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	FGD4	Q96M96	766 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	MMP19	Q99542	508 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	APBA2	Q99767	749 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	FFAR3	O14843	346 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	ASGR2	P07307	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	LIMS1	P48059	325 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	KCNC1	P48547	511 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	HTRA3	P83110	453 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	BVES	Q8NE79	360 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	COPS5	Q92905	334 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	AKT3	Q9Y243	479 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SNAP23-215	ENST00000568227	C7orf72	A4D263	438 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	ADRB1	P08588	477 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	CELA3B	P08861	270 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	ATF2	P15336	505 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	SLURP1	P55000	103 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	NFKB2	Q00653	900 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	VMAC	Q2NL98	169 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SNAP23-215	ENST00000568227	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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