RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.14■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 CALM1P0DP23 149 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 CALM2P0DP24 149 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 CALM3P0DP25 149 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.13■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 ADAMTS4O75173 837 aa22.12■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.12■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 APOA5Q6Q788 366 aa22.12■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.12■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 FANCBQ8NB91 859 aa22.12■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.12■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 H0YGN5 161 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 EDNRBP24530 442 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 SMARCA1P28370 1054 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 GNAQP50148 359 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 DNERQ8NFT8 737 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 MAF1Q9H063 256 aa22.11■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 MYADML2A6NDP7 307 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 KBTBD13C9JR72 458 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 EVI5O60447 810 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 CFBP00751 764 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 PTGS1P23219 599 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 RPS6KB1P23443 525 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 GHRHRQ02643 423 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 Q6ZUG5 572 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 RNF180Q86T96 592 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 VTA1Q9NP79 307 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 LCTP09848 1927 aa22.1■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.09■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 HSD17B4P51659 736 aa22.09■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 TNFAIP2Q03169 654 aa22.09■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.09■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.08■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 ZBTB43O43298 467 aa22.08■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 SMPD1P17405 629 aa22.08■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 PSMA5P28066 241 aa22.08■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 PDE4DQ08499 809 aa22.08■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.08■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 FERMT2Q96AC1 680 aa22.08■■□□□ 1.13
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EDC3-211ENST00000566243 PHF24Q9UPV7 400 aa22.08■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
EDC3-211ENST00000566243 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 CTAGE5O15320 804 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 GJA9P57773 515 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 FGD1P98174 961 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 APOBRQ0VD83 1088 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 TRAF1Q13077 416 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 RTN1Q16799 776 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 BRF1Q92994 677 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 RMDN3Q96TC7 470 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.07■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.06■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.06■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 FUT2Q10981 343 aa22.06■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 FBXL16Q8N461 479 aa22.06■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.06■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.06■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 POLR2MP0CAP2 368 aa22.05■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 CDC27P30260 824 aa22.05■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 KCNA10Q16322 511 aa22.05■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 RUFY3Q7L099 469 aa22.05■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
EDC3-211ENST00000566243 PXMP2Q9NR77 195 aa22.05■■□□□ 1.12
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