RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 LONP1P36776 959 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 AP3B2Q13367 1082 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANO10Q9NW15 660 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 OTOFQ9HC10 1997 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 TDP2O95551 362 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 OR52Z1P0C646 297 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDC25AP30304 524 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 HMGCS2P54868 508 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 LUZP1Q86V48 1076 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIK3CDO00329 1044 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 FLOT1O75955 427 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ICAM1P05362 532 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF165P49910 485 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ISM2Q6H9L7 571 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 POTEDQ86YR6 584 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 FDX1P10109 184 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRPHP41219 470 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 LDHDQ86WU2 507 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF536O15090 1300 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCB11O95342 1321 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PP2D1A8MPX8 630 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC37A4O43826 429 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRR29P0C7W0 189 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANO3Q9BYT9 981 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.18■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 POTEIP0CG38 1075 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 POTEJP0CG39 1038 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 POSTNQ15063 836 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP25Q9UHP3 1055 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.17■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLFN14P0C7P3 912 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 NLRP12P59046 1061 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPATQ06203 517 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 CALCRLQ16602 461 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 KANK3Q6NY19 840 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PNMA2Q9UL42 364 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAVIN2O95810 425 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 TXLNAP40222 546 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 TXKP42681 527 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 AFMP43652 599 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLCB2Q00722 1185 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 MOB2Q70IA6 237 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERO1BQ86YB8 467 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.16■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 PARP14Q460N5 1801 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 TECP42680 631 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP11P51784 963 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 KARSQ15046 597 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 TBC1D5Q92609 795 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 MTMR9Q96QG7 549 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ELP3Q9H9T3 547 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 RRAGCQ9HB90 399 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.15■□□□□ 0.82
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 VWA5AO00534 786 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBED4O75132 1171 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 DSG3P32926 999 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 UBA7P41226 1012 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 COG2Q14746 738 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 IQCB1Q15051 598 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 E2F4Q16254 413 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 IQUBQ8NA54 791 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 PAGE5Q96GU1 130 aa20.14■□□□□ 0.81
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms