RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556692.1

RDH11-208, Transcript of retinol dehydrogenase 11, human

TSL 2

Gene RDH11, Length 801 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDH11-208	ENST00000556692	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	DNAJA2	O60884	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	HTR3B	O95264	441 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	MEIS1	O00470	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	MUSK	O15146	869 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	SURF1	Q15526	300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	NAT16	Q8N8M0	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	GOLGA3	Q08378	1498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	GART	P22102	1010 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	PML	P29590	882 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	PWP1	Q13610	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	MPP2	Q14168	576 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	CFTR	P13569	1480 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	ZNF205	O95201	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	TACR1	P25103	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	BMP8B	P34820	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	SELENOP	P49908	381 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	RGS13	O14921	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	VAV1	P15498	845 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	SYNJ2	O15056	1496 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RDH11-208	ENST00000556692	GPR42	O15529	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	UBOX5	O94941	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	MLEC	Q14165	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	CSRP2	Q16527	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	GREM1	O60565	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	RAG1	P15918	1043 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	DPT	Q07507	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	JADE2	Q9NQC1	790 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RDH11-208	ENST00000556692	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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