RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 GMCL1Q96IK5 515 aa19.11■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 NACAP1Q9BZK3 213 aa19.11■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 IL17RBQ9NRM6 502 aa19.11■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 CCPG1Q9ULG6 757 aa19.11■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 TRANK1O15050 2925 aa19.11■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 PLIN4Q96Q06 1357 aa19.1■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 TSPY2A6NKD2 308 aa19.1■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 FDX1P10109 184 aa19.1■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 CCDC96Q2M329 555 aa19.1■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 TKFCQ3LXA3 575 aa19.1■□□□□ 0.65
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CS-227ENST00000551441 RCSD1Q6JBY9 416 aa19.1■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 FSD1Q9BTV5 496 aa19.1■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.1■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa19.1■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 BDP1A6H8Y1 2624 aa19.09■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CS-227ENST00000551441 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
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CS-227ENST00000551441 CHMP4BP1P59074 171 aa19.08■□□□□ 0.64
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CS-227ENST00000551441 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa19.08■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 TNKSO95271 1327 aa19.07■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.07■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 EPOPA6NHQ4 379 aa19.07■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 NFIBO00712 420 aa19.07■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 OR6J1Q8NGC5 347 aa19.07■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 COPS5Q92905 334 aa19.07■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 VTA1Q9NP79 307 aa19.07■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 GPCPD1Q9NPB8 672 aa19.07■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP19.07■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 FOXP2O15409 715 aa19.06■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 ARHGEF15O94989 841 aa19.06■□□□□ 0.64
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CS-227ENST00000551441 CALML3P27482 149 aa19.06■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 DUSP28Q4G0W2 176 aa19.06■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa19.06■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 VPS53Q5VIR6 699 aa19.06■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 SLC30A10Q6XR72 485 aa19.06■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 PLA2G6O60733 806 aa19.05■□□□□ 0.64
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CS-227ENST00000551441 PURAQ00577 322 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 NBPF20Q3BBV1 942 aa19.05■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 TMEM67Q5HYA8 995 aa19.05■□□□□ 0.64
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CS-227ENST00000551441 SPRED2Q7Z698 418 aa19.05■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 PI4K2BQ8TCG2 481 aa19.05■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 ARNTL2Q8WYA1 636 aa19.05■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 TOMM22Q9NS69 142 aa19.05■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 Q9Y3F1 56 aa19.05■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 MORC4Q8TE76 937 aa19.04■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.04■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 POLR3EQ9NVU0 708 aa19.04■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 MTCH2Q9Y6C9 303 aa19.04■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 SYDE2Q5VT97 1194 aa19.03■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 NCOR1O75376 2440 aa19.03■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa19.02■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 CPT1AP50416 773 aa19.02■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 TET1Q8NFU7 2136 aa19.02■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 DCAF4Q8WV16 495 aa19.02■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa19.02■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
CS-227ENST00000551441 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 ERC2O15083 957 aa19.01■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 CLEC4DQ8WXI8 215 aa19.01■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 TMEM47Q9BQJ4 181 aa19.01■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 TTC41PQ6P2S7 1318 aa19■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 IQCF3P0C7M6 154 aa19■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 ACTN1P12814 892 aa19■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 TAP1Q03518 808 aa19■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 PDE4DQ08499 809 aa19■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 RNF207Q6ZRF8 634 aa19■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 RETREG2Q8NC44 543 aa19■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 EPHX3Q9H6B9 360 aa19■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 PTPRSQ13332 1948 aa19■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa18.99■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 ARIH2O95376 493 aa18.99■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 PFKMP08237 780 aa18.99■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 PPP2R5BQ15173 497 aa18.99■□□□□ 0.63
CS-227ENST00000551441 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.99■□□□□ 0.63
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