RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 LRRN2O75325 713 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 PLCG1P19174 1290 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 RRP1P56182 461 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 EGR3Q06889 387 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 KCNA10Q16322 511 aa7.06□□□□□ -1.28
TRDN-205ENST00000546248 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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TRDN-205ENST00000546248 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.06□□□□□ -1.28
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TRDN-205ENST00000546248 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
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TRDN-205ENST00000546248 POLKQ9UBT6 870 aa7.04□□□□□ -1.28
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TRDN-205ENST00000546248 LILRA6Q6PI73 481 aa7.03□□□□□ -1.28
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TRDN-205ENST00000546248 KCNN1Q92952 543 aa7.03□□□□□ -1.28
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TRDN-205ENST00000546248 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 EBF1Q9UH73 591 aa7.02□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 ATP7BP35670 1465 aa7.01□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 KCNA6P17658 529 aa7□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 IL13P35225 146 aa7□□□□□ -1.29
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TRDN-205ENST00000546248 OXR1Q8N573 874 aa7□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 FBXO27Q8NI29 283 aa7□□□□□ -1.29
TRDN-205ENST00000546248 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7□□□□□ -1.29
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