RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	GLDC	P23378	1020 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	TACR1	P25103	407 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	GFRA1	P56159	465 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	NFIB	O00712	420 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	ABLIM1	O14639	778 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	DBH	P09172	617 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	VIPR1	P32241	457 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	ECI1	P42126	302 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	GRIA2	P42262	883 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	RBL2	Q08999	1139 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SERINC3	Q13530	473 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	KCNN1	Q92952	543 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	ARNTL	O00327	626 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PDPK1	O15530	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	NPHS1	O60500	1241 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	CP	P00450	1065 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	CYBB	P04839	570 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	GLI4	P10075	376 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	KCNJ6	P48051	423 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	DLG4	P78352	724 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	NR1I3	Q14994	352 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	TESK1	Q15569	626 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	INF2	Q27J81	1249 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	DPF3	Q92784	378 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	DBX1	A6NMT0	343 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	LTBR	P36941	435 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	EPHB3	P54753	998 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	JAG1	P78504	1218 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	SPATC1	Q76KD6	591 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-233	ENST00000545204	CABP7	Q86V35	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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