RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 ANO1Q5XXA6 986 aa28.1■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 KCNB2Q92953 911 aa28.1■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 TNFAIP2Q03169 654 aa28.09■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 IWS1Q96ST2 819 aa28.09■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 SENP2Q9HC62 589 aa28.09■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
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PITX3-202ENST00000539804 CST5P28325 142 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
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PITX3-202ENST00000539804 PPP2R5BQ15173 497 aa28.08■■■□□ 2.09
PITX3-202ENST00000539804 SLC30A10Q6XR72 485 aa28.08■■■□□ 2.09
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PITX3-202ENST00000539804 PHF24Q9UPV7 400 aa28.08■■■□□ 2.09
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PITX3-202ENST00000539804 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
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PITX3-202ENST00000539804 C1orf53Q5VUE5 145 aa28.06■■■□□ 2.08
PITX3-202ENST00000539804 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.06■■■□□ 2.08
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PITX3-202ENST00000539804 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
PITX3-202ENST00000539804 RTP1P59025 263 aa27.99■■■□□ 2.07
PITX3-202ENST00000539804 RTN1Q16799 776 aa27.99■■■□□ 2.07
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PITX3-202ENST00000539804 TMTC3Q6ZXV5 915 aa27.99■■■□□ 2.07
PITX3-202ENST00000539804 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PITX3-202ENST00000539804 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
PITX3-202ENST00000539804 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
PITX3-202ENST00000539804 SMPD1P17405 629 aa27.98■■■□□ 2.07
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