RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532316.1

PKNOX2-AS1-201, Transcript of PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PKNOX2-AS1, Length 586 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EEPD1Q7L9B9 569 aa27.68■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MCF2L2Q86YR7 1114 aa27.68■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MAP4K1Q92918 833 aa27.68■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa27.68■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRIM43BA6NCK2 446 aa27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIAA0355O15063 1070 aa27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SMPD1P17405 629 aa27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PDE4DQ08499 809 aa27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LRCH3Q96II8 777 aa27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CPVLQ9H3G5 476 aa27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LTBP2Q14767 1821 aa27.67■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 E7EWF7 191 aa27.66■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CTAGE5O15320 804 aa27.66■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DUSP28Q4G0W2 176 aa27.66■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.66■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FBXO11Q86XK2 927 aa27.66■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BADQ92934 168 aa27.66■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PDGFCQ9NRA1 345 aa27.66■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TMEM39AQ9NV64 488 aa27.66■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LAMA3Q16787 3333 aa27.65■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARVCFO00192 962 aa27.65■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RAG1P15918 1043 aa27.65■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EDNRBP24530 442 aa27.65■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TRAF1Q13077 416 aa27.65■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 QRICH1Q2TAL8 776 aa27.65■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 JMJD4Q9H9V9 463 aa27.65■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LCTP09848 1927 aa27.65■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KLRF2D3W0D1 207 aa27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TLR3O15455 904 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CDK7P50613 346 aa27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FAAP100Q0VG06 881 aa27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WTAPQ15007 396 aa27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 AMNQ9BXJ7 453 aa27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WDR11Q9BZH6 1224 aa27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BEX3Q00994 111 aa27.63■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 VAT1LQ9HCJ6 419 aa27.63■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SCFD2Q8WU76 684 aa27.62■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MTA3Q9BTC8 594 aa27.62■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MAD2L2Q9UI95 211 aa27.62■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SZT2Q5T011 3432 aa27.62■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CPT1AP50416 773 aa27.61■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GRM4Q14833 912 aa27.61■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.61■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CXCL17Q6UXB2 119 aa27.61■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 STAG2Q8N3U4 1231 aa27.61■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZBTB5O15062 677 aa27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PPP2R5BQ15173 497 aa27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TMEM67Q5HYA8 995 aa27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CATIPQ7Z7H3 387 aa27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SAMD3Q8N6K7 520 aa27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MTMR8Q96EF0 704 aa27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IWS1Q96ST2 819 aa27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 POLR3EQ9NVU0 708 aa27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TBX21Q9UL17 535 aa27.6■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FPGSQ05932 587 aa27.59■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 STOX1Q6ZVD7 989 aa27.59■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SLC43A3Q8NBI5 491 aa27.59■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TIMP1P01033 207 aa27.58■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ITGA7Q13683 1181 aa27.58■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TTLL4Q14679 1199 aa27.58■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CASC1Q6TDU7 716 aa27.58■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FAM126BQ8IXS8 530 aa27.58■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TAF6LQ9Y6J9 622 aa27.58■■■□□ 2.01
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ITGB8P26012 769 aa27.57■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GHRHRQ02643 423 aa27.57■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TROAPQ12815 778 aa27.57■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SHHQ15465 462 aa27.57■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 OR6J1Q8NGC5 347 aa27.57■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RMDN3Q96TC7 470 aa27.57■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MAP3K14Q99558 947 aa27.57■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.57■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KPNA6O60684 536 aa27.56■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 STXBP2Q15833 593 aa27.56■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TMTC2Q8N394 836 aa27.56■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DEFB123Q8N688 67 aa27.56■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa27.56■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa27.56■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CFBP00751 764 aa27.55■■■□□ 2
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TXNP10599 105 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms