RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC35G1Q2M3R5 365 aa27.97■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 VAT1LQ9HCJ6 419 aa27.97■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 LTBP2Q14767 1821 aa27.97■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 ELP1O95163 1332 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 EDNRBP24530 442 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 CDK7P50613 346 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 FAAP100Q0VG06 881 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 TRDNQ13061 729 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 IQSEC1Q6DN90 963 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 CHST3Q7LGC8 479 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 GLT1D1Q96MS3 346 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 MAD2L2Q9UI95 211 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA0355O15063 1070 aa27.95■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 ANTXR2P58335 489 aa27.95■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.95■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 RGS22Q8NE09 1264 aa27.95■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 TOX2Q96NM4 488 aa27.95■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa27.94■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 C9orf50Q5SZB4 431 aa27.94■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 CXCL17Q6UXB2 119 aa27.94■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 COL20A1Q9P218 1284 aa27.94■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCB11O95342 1321 aa27.93■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 NCOA7Q8NI08 942 aa27.93■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 AP5M1Q9H0R1 490 aa27.93■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM39AQ9NV64 488 aa27.93■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 KLRF2D3W0D1 207 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 EPHB4P54760 987 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 SHHQ15465 462 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 DUSP28Q4G0W2 176 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXO11Q86XK2 927 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 DNERQ8NFT8 737 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 VTI1AQ96AJ9 217 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 MTMR8Q96EF0 704 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 WDR11Q9BZH6 1224 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 TBX21Q9UL17 535 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 Q9Y3F1 56 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 GRIN2DO15399 1336 aa27.92■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 ARVCFO00192 962 aa27.91■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 OPLAHO14841 1288 aa27.91■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 GRM4Q14833 912 aa27.91■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 DCDC2CA8MYV0 355 aa27.9■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 PDE4DQ08499 809 aa27.9■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM126BQ8IXS8 530 aa27.9■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa27.9■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 TAAR1Q96RJ0 339 aa27.9■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 RAG1P15918 1043 aa27.89■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 TROAPQ12815 778 aa27.89■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 Q7L0L9 218 aa27.89■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC43A3Q8NBI5 491 aa27.89■■■□□ 2.06
PACSIN3-204ENST00000528201 WTAPQ15007 396 aa27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM67Q5HYA8 995 aa27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 CYTH3O43739 400 aa27.87■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 ARIH2O95376 493 aa27.87■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 PSMC6P62333 389 aa27.87■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.87■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 GPR153Q6NV75 609 aa27.87■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 COPS5Q92905 334 aa27.87■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 ERICH2A1L162 156 aa27.86■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC27A2O14975 620 aa27.86■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 ZBTB5O15062 677 aa27.86■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 CD4P01730 458 aa27.86■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 MCF2L2Q86YR7 1114 aa27.86■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 AMNQ9BXJ7 453 aa27.86■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 MAF1Q9H063 256 aa27.86■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.86■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 MROH7Q68CQ1 1323 aa27.86■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 CABYRO75952 493 aa27.85■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 ITGA7Q13683 1181 aa27.85■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 HOMER1Q86YM7 354 aa27.85■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 SCFD2Q8WU76 684 aa27.85■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 PIGSQ96S52 555 aa27.85■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 LY9Q9HBG7 655 aa27.85■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 COL6A3P12111 3177 aa27.85■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 ZEB2O60315 1214 aa27.84■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 TIMP1P01033 207 aa27.84■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 HSD17B4P51659 736 aa27.84■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 GHRHRQ02643 423 aa27.84■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 SART3Q15020 963 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP2R5BQ15173 497 aa27.84■■■□□ 2.05
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