RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 SKAP1Q86WV1 359 aa21.46■■□□□ 1.03
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TSPAN4-216ENST00000526055 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.46■■□□□ 1.03
TSPAN4-216ENST00000526055 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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TSPAN4-216ENST00000526055 FERMT2Q96AC1 680 aa21.45■■□□□ 1.02
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TSPAN4-216ENST00000526055 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.45■■□□□ 1.02
TSPAN4-216ENST00000526055 ELP1O95163 1332 aa21.45■■□□□ 1.02
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TSPAN4-216ENST00000526055 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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TSPAN4-216ENST00000526055 LY9Q9HBG7 655 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN4-216ENST00000526055 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.44■■□□□ 1.02
TSPAN4-216ENST00000526055 LCTP09848 1927 aa21.44■■□□□ 1.02
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TSPAN4-216ENST00000526055 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.43■■□□□ 1.02
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TSPAN4-216ENST00000526055 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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TSPAN4-216ENST00000526055 DUSP28Q4G0W2 176 aa21.42■■□□□ 1.02
TSPAN4-216ENST00000526055 SZT2Q5T011 3432 aa21.42■■□□□ 1.02
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TSPAN4-216ENST00000526055 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa21.41■■□□□ 1.02
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TSPAN4-216ENST00000526055 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.4■■□□□ 1.02
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TSPAN4-216ENST00000526055 CALM3P0DP25 149 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN4-216ENST00000526055 TLE2Q04725 743 aa21.4■■□□□ 1.02
TSPAN4-216ENST00000526055 KRT32Q14532 448 aa21.4■■□□□ 1.02
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TSPAN4-216ENST00000526055 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-216ENST00000526055 CLTBP09497 229 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-216ENST00000526055 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-216ENST00000526055 HOMER1Q86YM7 354 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-216ENST00000526055 TDHQ8IZJ6 230 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-216ENST00000526055 TBC1D5Q92609 795 aa21.38■■□□□ 1.01
TSPAN4-216ENST00000526055 NEK1Q96PY6 1258 aa21.38■■□□□ 1.01
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