RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525194.5

ACER3-202, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACER3, Length 846 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-202ENST00000525194 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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ACER3-202ENST00000525194 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.15■■□□□ 1.62
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ACER3-202ENST00000525194 LETM2Q2VYF4 491 aa25.15■■□□□ 1.62
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ACER3-202ENST00000525194 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
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ACER3-202ENST00000525194 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.14■■□□□ 1.62
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ACER3-202ENST00000525194 NBR1Q14596 966 aa25.13■■□□□ 1.61
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ACER3-202ENST00000525194 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
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ACER3-202ENST00000525194 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-202ENST00000525194 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ACER3-202ENST00000525194 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.13■■□□□ 1.61
ACER3-202ENST00000525194 ALDH1A1P00352 501 aa25.12■■□□□ 1.61
ACER3-202ENST00000525194 CYP3A4P08684 503 aa25.12■■□□□ 1.61
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