RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.94□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 MTA3Q9BTC8 594 aa5.94□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.94□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 C7orf72A4D263 438 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 NOP56O00567 594 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 PDPK1O15530 556 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 DLX3O60479 287 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 NAT2P11245 290 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 HOXC12P31275 282 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 SEPHS1P49903 392 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 YBX1P67809 324 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 RASGRF1Q13972 1273 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 IRF2BP1Q8IU81 584 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 OSBP2Q969R2 916 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 DIRC2Q96SL1 478 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 NAT16Q8N8M0 369 aa5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 SGSM3Q96HU1 749 aa5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 MMP19Q99542 508 aa5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 TAF6LQ9Y6J9 622 aa5.92□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 TBC1D8O95759 1140 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 LCP1P13796 627 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 L1CAMP32004 1257 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 NTRK3Q16288 839 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 NUP43Q8NFH3 380 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 PLEKHO2Q8TD55 490 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 SLC6A17Q9H1V8 727 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 CDIP1Q9H305 208 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 GCM1Q9NP62 436 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 SNTG2Q9NY99 539 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.91□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 MRC2Q9UBG0 1479 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 GLI4P10075 376 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 PAMP19021 973 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 ECI1P42126 302 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 CORO7P57737 925 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 CYP4F8P98187 520 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 LAPTM5Q13571 262 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 JMYQ8N9B5 988 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 IER2Q9BTL4 223 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 SPATA9Q9BWV2 254 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 PDLIM7Q9NR12 457 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 LRP2BPQ9P2M1 347 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 GULP1Q9UBP9 304 aa5.9□□□□□ -1.46
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC85CA6NKD9 419 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 C8AP07357 584 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 FAM153BP0C7A2 387 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 FGFR1P11362 822 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 TACR1P25103 407 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 ADGRF1Q5T601 910 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF605Q86T29 641 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 NLRP10Q86W26 655 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC140Q96MF4 163 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 EPB41L4BQ9H329 900 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 RWDD3Q9Y3V2 267 aa5.89□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 HRKO00198 91 aa5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 MSCO60682 206 aa5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 PEX10O60683 326 aa5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 DBHP09172 617 aa5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 FBLN1P23142 703 aa5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 VIPR1P32241 457 aa5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 PDE6BP35913 854 aa5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 MAP4K2Q12851 820 aa5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF124Q15973 351 aa5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 RPTNQ6XPR3 784 aa5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 JAMLQ86YT9 394 aa5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 KSR1Q8IVT5 923 aa5.88□□□□□ -1.47
CLVS1-209ENST00000522928 Q8N1Y9 231 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms