RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518848.5

HOXA-AS3-201, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXA-AS3, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.1■□□□□ 0.81
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HOXA-AS3-201ENST00000518848 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXA-AS3-201ENST00000518848 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PITPNM1O00562 1244 aa20.01■□□□□ 0.79
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HOXA-AS3-201ENST00000518848 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.01■□□□□ 0.79
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