RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 CBX4O00257 560 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 ZEB2O60315 1214 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNAB2Q13303 367 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 KIF18BQ86Y91 864 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 IGSF22Q8N9C0 903 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM8Q9BZR9 551 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF205O95201 554 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 LCP1P13796 627 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 NEK2P51955 445 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP27C1Q4G0S4 372 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 EEF1DP3Q658K8 133 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 LBX2Q6XYB7 198 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 NXPE1Q8N323 547 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 COG1Q8WTW3 980 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 DIO2Q92813 273 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 CRTAC1Q9NQ79 661 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 GPATCH2Q9NW75 528 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 HMX2A2RU54 273 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM170BA6NMN3 283 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 M0R2C6 588 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 WIPF1O43516 503 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 RTP2Q5QGT7 225 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF765Q7L2R6 523 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 SHISA5Q8N114 240 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDH19Q8TAB3 1148 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 C8orf48Q96LL4 319 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 ALG1Q9BT22 464 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 C7orf69Q9H7B7 122 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 GABBR1Q9UBS5 961 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 COQ6Q9Y2Z9 468 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-205ENST00000514178 TSPAN6O43657 245 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 F2P00734 622 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 CKMP06732 381 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 SYPP08247 313 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 GSTM1P09488 218 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 DSG1Q02413 1049 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 PAK1Q13153 545 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP2R5AQ15172 486 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 CNTD1Q8N815 330 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 SHTN1A0MZ66 631 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR64B1ANS9 1081 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 PYGMP11217 842 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 ADCYAP1R1P41586 468 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 TBX4P57082 545 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 IL2P60568 153 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC41Q15345 812 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 IQCEQ6IPM2 695 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 LINC00116Q8NCU8 138 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 RCBTB1Q8NDN9 531 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 SMC1BQ8NDV3 1235 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 POLR3GLQ9BT43 218 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 TRHDEQ9UKU6 1024 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 U3KQE9 123 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 WASH4PA8MWX3 477 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAF5O00463 557 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB27AP51159 221 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 KIZQ2M2Z5 673 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 CDKAL1Q5VV42 579 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 USHBP1Q8N6Y0 703 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 MMP19Q99542 508 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 FKBP9O95302 570 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 SCGB1D2O95969 90 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 PAMP19021 973 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP27A1Q02318 531 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 INF2Q27J81 1249 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM177Q53S58 311 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 MBLAC2Q68D91 279 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 FKBP9P1Q75LS8 142 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXL6Q8N531 539 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 YIPF4Q9BSR8 244 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXP3Q9BZS1 431 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 CABP5Q9NP86 173 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 TCFL5Q9UL49 500 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 RAXQ9Y2V3 346 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-205ENST00000514178 GABRDO14764 452 aa10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms